| 铁筷子嫩叶转录组信息及SSR标记初步分析 |
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| 引用本文： | 史小华,马广莹,邹清成,田丹青. 铁筷子嫩叶转录组信息及SSR标记初步分析[J]. 分子植物育种, 2019, 17(10): 3297-3304 |
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| 作者姓名： | 史小华 马广莹 邹清成 田丹青 |
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| 作者单位： | 浙江省农业科学院花卉研究开发中心,农业部创意农业重点实验室,杭州,311202;浙江省农业科学院花卉研究开发中心,农业部创意农业重点实验室,杭州,311202;浙江省农业科学院花卉研究开发中心,农业部创意农业重点实验室,杭州,311202;浙江省农业科学院花卉研究开发中心,农业部创意农业重点实验室,杭州,311202 |
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| 基金项目： | 浙江省杭州市农业科研攻关专项 |
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| 摘 要： | 铁筷子是毛茛科植物,既是重要中药材,也是新兴的高档宿根花卉。本研究以中国原产铁筷子幼嫩叶片为试材,采用二代测序技术对材料进行转录组测序,通过对原始数据进行质量控制,并用Trinity软件等对处理后数据进行拼接,获得了高质量转录本和Unigenes。对Unigenes进行序列比对、功能注释和分类、基因编码区预测及单核苷酸多肽标记(SSR)分析,结果显示,本次测序共获得转录本94 067条,代表的Unigene共有70 119条;Unigenes在非冗余蛋白数据库(Nr)比对,E值得分最高的物种中,睡莲占比最高;Unigenes在GO分类中注释到46个次级功能条目,在KOG功能分类中"翻译后修饰,蛋白开关和分子伴侣"功能注释到的基因最多;通过Nr数据库和软件分析,共有58 403个基因编码区被预测到;同时软件分析共获得SSR分子标记9 057条。本研究较早地为铁筷子的分子研究提供了转录组数据,相关研究结果对促进今后铁筷子基因发掘、分子标记育种等工作将产生积极意义。
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| 关 键 词： | 铁筷子 转录组 SSR 功能注释 |
Preliminary Analysis of Transcriptome Information and SSR Markers in Young Leaves of Helleborus thibetanus |
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| Shi Xiaohua,Ma Guangying,Zou Qingcheng,Tian Danqing. Preliminary Analysis of Transcriptome Information and SSR Markers in Young Leaves of Helleborus thibetanus[J]. Molecular Plant Breeding, 2019, 17(10): 3297-3304 |
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| Authors: | Shi Xiaohua Ma Guangying Zou Qingcheng Tian Danqing |
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| Affiliation: | (Key Laboratory of Creative Agriculture,Ministry of Agriculture,Floriculture Research and Development Center,Zhejiang Academy of Agricultural Sciences,Hangzhou,311202) |
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| Abstract: | Shi Xiaohua;Ma Guangying;Zou Qingcheng;Tian Danqing(Key Laboratory of Creative Agriculture,Ministry of Agriculture,Floriculture Research and Development Center,Zhejiang Academy of Agricultural Sciences,Hangzhou,311202) |
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