| 小麦TaNIP4-1基因的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 曹荣珍,闻珊珊.小麦TaNIP4-1基因的克隆及生物信息学分析[J].麦类作物学报,2017(10):1285-1293. |
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| 作者姓名： | 曹荣珍 闻珊珊 |
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| 作者单位： | （西北农林科技大学农学院，陕西杨凌 712100） |
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| 基金项目： | 西北农林科技大学引进人才科研启动项目（Z111021401）；西北农林科技大学基本科研-创新一般项目（Z109021508） |
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| 摘 要： | 水通道蛋白不仅控制着水分和一些小分子溶质的跨膜运输,也是植物体应对非生物胁迫的重要组成部分。为了进一步研究小麦水通道蛋白的功能,本研究以NCBI和Ensemble Plant数据库中查找出的已报道的小麦水通道蛋白基因序列为模板,针对其保守区设计了19对引物,应用PCR的方法从5个小麦品种中克隆出19个基因片段。通过比对鉴定到一个此前未曾报道的新基因,并对其进行生物信息学分析,将其命名为TaNIP4-1。理化特性分析表明,该基因位于3A染色体短臂,基因全长1 315bp,CDS序列长度864bp,含有3个外显子和2个内含子,编码含有288个氨基酸的多肽,含有保守的沙漏模型,有6个跨膜区和2个保守的NPA基序。亚细胞定位预测结果表明该基因位于质膜上。该基因启动子序列含有与逆境响应相关的顺式调控元件,而对7日龄的麦苗进行干旱和盐胁迫处理后,其qRT-PCR结果显示,干旱和盐处理5h后,TaNIP4-1基因在小麦叶片中的表达量明显上调;盐处理7d后,TaNIP4-1基因在小麦根部的表达量显著上调。由此可见,TaNIP4-1基因参与了小麦应对逆境的过程。
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| 关 键 词： | 小麦 水通道蛋白 TaNIP4-1 生物信息学 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of TaNIP4-1 in Wheat |
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| CAO Rongzhen,WEN Shanshan.Cloning and Bioinformatics Analysis of TaNIP4-1 in Wheat[J].Journal of Triticeae Crops,2017(10):1285-1293. |
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| Authors: | CAO Rongzhen WEN Shanshan |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Wheat Aquaporin TaNIP4-1 Bioinformatics |
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