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辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析
引用本文:刘冬梅,洪权春,陈文超,丁锦平,陈姝彤,徐园园,韩霜,朱晓琴,王亚月,裴冬丽.辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析[J].辣椒杂志,2019(3).
作者姓名:刘冬梅  洪权春  陈文超  丁锦平  陈姝彤  徐园园  韩霜  朱晓琴  王亚月  裴冬丽
作者单位:商丘师范学院生物与食品学院植物与微生物互作省级重点实验室,河南省干制辣椒产业技术院士工作站,河南商丘 476000;湖南省蔬菜研究所,长沙 410125
基金项目:国家自然科学基金;河南省教育厅项目
摘    要:为研究辣椒氨基转移酶(pAMT,putative aminotransferase)基因在辣椒基因组中的分布和功能,以尊辣1号基因组为参照,利用生物信息学方法对辣椒中pAMT基因家族成员进行全基因组水平分析。结果显示:辣椒基因组中存在9个pAMT基因家族成员,集中分布在8号和9号染色体上,氨基酸序列多重比对显示这9个蛋白分别聚类到3大分支上。结构分析表明,pAMT家族所有蛋白均含有5个保守结构域Motif 2、Motif 3、Motif 5、Motif 8和Motif 9。基因表达分析结果显示:基因Capana09g000427在叶片中不表达,在果皮中表达量最高,其次是子房,在种子和胎座也有表达。基因Capana08g000160在种子、胎座中不表达,仅在叶片中表达稍高,在其他组织的表达量均较低。辣椒氨基转移酶pAMT基因家族在基因组中的分布分析为进一步研究辣椒氨基转移酶pAMT基因家族的功能提供了科学依据。

关 键 词:辣椒素  pAMT  基因家族  生物信息学分析
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