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| 珠三角地区鸭坦布苏病毒的全基因序列测定与分析 | |
| 引用本文： | 张克山,陈芳艳,刘金,蔡丝丝,刘湘红,张靖鹏,陈瑞爱,王林川. 珠三角地区鸭坦布苏病毒的全基因序列测定与分析[J]. 华南农业大学学报, 2015, 36(3): 13-19 |
| 作者姓名： | 张克山 陈芳艳 刘金 蔡丝丝 刘湘红 张靖鹏 陈瑞爱 王林川 |
| 作者单位： | 1. 华南农业大学兽医学院,广东广州,510642 2. 华南农业大学动物科学学院,广东广州,510642 3. 华南农业大学兽医学院,广东广州510642;广东大华农动物保健品股份有限公司,广东新兴527400 |
| 基金项目： | 广东大华农动物保健品股份有限公司科研基金（113A2012206-1） |
| 摘 要： | 【目的】了解2010年以来分离于珠三角地区鸭坦布苏病毒病(Duck Tembusu virus,DTMUV)GDNS2010.1、GDNS2010.2、GDZQ2012、GDPY2013株的分子特征.【方法】参考Gen Bank收藏的DTMUV JS804株,共设计合成11对特异性引物,扩增了4株病毒的全基因序列片段.【结果和结论】4株病毒全长约为10 990 bp,无Ploy(A)尾结构,仅含有1个大的ORF,共编码3 426个氨基酸,5'非编码区(5'UTR)各含有94 bp.在3'非编码区(3'UTR),GDNS2010.1、GDNS2010.2毒株在103 395~103 411 bp处缺失10个碱基.联合前期试验已测定的2株病毒序列(GDHZ2012.1、GDHZ2012.2),用DNAstar和MEGA6.0序列分析软件将6株病毒同Gen Bank收藏的国内的其他坦布苏病毒株比对,发现核酸序列相似性在98%以上,与Ntaya病毒和Sitiawan病毒相似性较大,相似性都在73%左右;与西尼罗河病毒、日本乙型脑炎病毒、黄热病毒等相似性皆低于63%.6株病毒囊膜蛋白E核酸序列相似性为97.5%~99.9%,推导氨基酸序列相似性在97%以上,其中同一地区分离的毒株相似性最高,达99.9%;在囊膜蛋白E154位存在一潜在的糖基化位点Asn-Try-Ser,在E蛋白结构域Ⅱ第E289位,极性带正电荷的Lys变为极性带负电荷的Glu,推测这一位点可能为病毒的毒力位点. |
| 关 键 词： | 鸭坦布苏病毒 克隆测序 全基因组序列 囊膜蛋白毒力位点 鸭黄病毒 |
| 收稿时间： | 2014-04-09 |
Molecular cloning and sequence analyses of the complete genome of duck Tembusu virus isolated from the Pearl River Delta region |
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| ZHANG Keshan,CHEN Fangyan,LIU Jin,CAI Sisi,LIU Xianghong,ZHANG Jingpeng,CHEN Ruiai and WANG Linchuan. Molecular cloning and sequence analyses of the complete genome of duck Tembusu virus isolated from the Pearl River Delta region[J]. JOURNAL OF SOUTH CHINA AGRICULTURAL UNIVERSITY, 2015, 36(3): 13-19 | |
| Authors: | ZHANG Keshan CHEN Fangyan LIU Jin CAI Sisi LIU Xianghong ZHANG Jingpeng CHEN Ruiai WANG Linchuan |
| Affiliation: | ZHANG Keshan;CHEN Fangyan;LIU Jin;CAI Sisi;LIU Xianghong;ZHANG Jingpeng;CHEN Ruiai;WANG Linchuan;College of Veterinary,South China Agricultural University;College of Animal Science,South China Agricultural University;Guangdong Dahuanong Animal Health Products Co. ,Ltd.; |
| Abstract: | |
| Keywords: | duck Tembusu virus cloning and sequencing complete genome sequence virulence loci in envelope protein duck flavivirus |
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