| 玉米子粒脂肪含量的全基因组关联分析 |
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| 引用本文： | 董青松,代力强,吴律,施婷婷,王丕武.玉米子粒脂肪含量的全基因组关联分析[J].玉米科学,2018,26(2):58-63. |
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| 作者姓名： | 董青松 代力强 吴律 施婷婷 王丕武 |
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| 作者单位： | 吉林农业大学 |
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| 基金项目： | 吉林省农委资助项目（2012）、农业部“948”项目（2013-Z47） |
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| 摘 要： | 利用分子标记对控制玉米脂肪合成的关键基因进行定位,从分子水平上阐明其遗传机理,提高高油玉米的育种效率。以吉林省80份核心玉米自交系为关联群体,2014年和2015年分别在吉林农业大学试验地进行田间试验,将自交收获的果穗晾晒脱粒后用NIRFlex N-500近红外光谱仪测定其子粒脂肪含量。同时使用Illumina PE150测序仪对80份玉米自交系进行全基因组重测序,共获得1 490 007个高质量的SNP用于后续的关联分析。结果表明,玉米子粒脂肪含量的变异范围为2.83%~6.81%,广义遗传力为63.3%。经过两年1点的全基因组关联分析共筛选得到10个SNP位点与子粒的脂肪含量显著关联(P0.000 001),解释的表型贡献率为0.65%~34.5%,其中位于染色体框4.01的SNP标记表型贡献率最高为34.5%。在显著性SNP位点(P0.000 001)的连锁不平衡区域(5.2 kb)内共挖掘出6个候选基因,分别预测编码MYB转录因子、果胶酯酶、谷氨酰胺合成酶和3种无特征功能的假定蛋白,可能与脂肪的合成代谢密切相关,可为高油玉米材料的分子标记辅助选择及克隆调控玉米子粒脂肪含量的关键基因提供参考。
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| 关 键 词： | 玉米 脂肪 全基因组重测序 全基因组关联分析 候选基因 |
| 收稿时间： | 2017/8/4 0:00:00 |
Genome-wide Association Analysis of Fat Content in Maize |
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| DONG Qing-song,DAI Li-qiang,WU Lu,SHI Ting-ting and WANG Yu-wu.Genome-wide Association Analysis of Fat Content in Maize[J].Journal of Maize Sciences,2018,26(2):58-63. |
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| Authors: | DONG Qing-song DAI Li-qiang WU Lu SHI Ting-ting and WANG Yu-wu |
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| Institution: | Jilin Agricultural University, Changchun 130124, China,Jilin Agricultural University, Changchun 130124, China,Jilin Agricultural University, Changchun 130124, China,Jilin Agricultural University, Changchun 130124, China and Jilin Agricultural University, Changchun 130124, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Maize Fat content Whole genome resequencing Genome-wide association analysis Candidate-genes |
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