| MSTN-/-鲁西黄牛肌肉全转录组共表达网络及转录本富集分析 |
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| 引用本文： | 强明威,陈星宇,王桥梦,胡德宝,张林林,李新,丁向彬,郭宏,郭益文.MSTN-/-鲁西黄牛肌肉全转录组共表达网络及转录本富集分析[J].黑龙江畜牧兽医,2024(7):59-67. |
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| 作者姓名： | 强明威 陈星宇 王桥梦 胡德宝 张林林 李新 丁向彬 郭宏 郭益文 |
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| 作者单位： | 天津农学院动物科学与动物医学学院/天津市农业动物繁育与健康养殖重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金青年科学基金项目(32102521)； |
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| 摘 要： | 为了探究与牛骨骼肌发育相关的共表达网络及核心转录本，挖掘牛骨骼肌在发育过程中的调控转录本，试验采用新的fastp+kallisto+Sleuth分析方法对牛骨骼肌转录组测序数据进行分析，通过转录组测序分析筛选出两组肌肉样本差异表达的RNA,对其进行GO功能注释分析和KEGG信号通路富集分析、WGCNA分析和GSEA富集分析。结果表明：转录组测序共鉴定出32 919个转录本，按照是否满足|lbFC|≥2、P<0.05的条件共筛选出457个差异表达转录本，其中上调转录本303个，下调转录本154个。457个差异表达转录本共涉及106个GO功能注释条目和14个KEGG信号通路，差异表达转录本主要富集在与细胞周期、细胞生长密切相关的基因功能注释和信号通路中。457个差异表达转录本被划分到显著相关的3个转录本模块，棕色模块有83个转录本，蓝色模块有93个转录本，绿色模块有111个转录本，并且筛选出10个核心转录本。核心转录本多数集中在细胞黏附分子、AMPK信号通路、PI3K-Akt信号通路、肌动蛋白细胞骨架的调节等与细胞周期、细胞生长密切相关的通路中。说明牛骨骼肌发育受基因转录水平调控的影...
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| 关 键 词： | 牛 骨骼肌 转录组 转录本 共表达网络分析 基因集富集分析 |
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