凡纳滨对虾不同养殖模式下微生物群落结构分析 |
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引用本文: | 张芹,吴小军,杨兴丽.凡纳滨对虾不同养殖模式下微生物群落结构分析[J].江苏农业科学,2024(6):225-235. |
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作者姓名: | 张芹 吴小军 杨兴丽 |
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作者单位: | 河南省水产科学研究院 |
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基金项目: | 国家现代农业产业技术体系建设专项(编号:CARS-45);;国家淡水水产种质资源库建设项目(编号:FGRC:18537); |
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摘 要: | 为了解不同养殖模式对凡纳滨对虾养殖环境微生物多样性和群落结构的影响,利用高通量测序技术,结合生物信息学分析,比较凡纳滨对虾主养模式和鱼-虾混养模式中水体、底泥以及虾肠道微生物的多样性和群落结构。结果显示,无论是物种的多样性水平还是丰富性水平,均是底泥>水>虾肠道,主养池塘底泥和虾肠道样品的物种多样性和丰富性均高于混养池塘。不同样品微生物群落的菌群分布于59个门,其中10个门的丰度>1%,变形菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)属于绝对优势菌群,在混养池塘和主养池塘中均>10%。主养池塘的微生物标志物共有8个类群,分别为双歧杆菌目(Bifidobacteriales)、双歧杆菌科(Bifidobacteriaceae)、双歧杆菌属(Bifidobacterium)等,混养池塘的微生物标志物共有18个类群,分别为蓝色芽殖杆菌属(Gemmobacter)、外硫红螺菌科(Ectothiorhodospiraceae)、外硫红螺菌属(Ectothiorhodospira)等。通过功能预测及其相对丰度比较,发现主养模式在这些代谢通路中...
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关 键 词: | 凡纳滨对虾 微生物群落结构 高通量测序 |
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