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甘蔗14-3-3基因克隆及表达分析
引用本文:罗炼芳,孔冉,苏俊波. 甘蔗14-3-3基因克隆及表达分析[J]. 广西农业科学, 2013, 0(11): 1757-1764
作者姓名:罗炼芳  孔冉  苏俊波
作者单位:中国热带农业科学院南亚热带作物研究所,广东湛江524091
基金项目:中国热带农业科学院中央级公益性科研院所基本科研业务专项项目(1630062012009)
摘    要:[目的]克隆甘蔗14-3-3基因并预测分析其编码蛋白的结构,为研究甘蔗基因功能和代谢调控机制提供参考.[方法]以水稻14-3-3基因为模板,BLAST甘蔗EST数据库,依据序列拼接结果及RT-PCR技术获得编码甘蔗14-3-3蛋白的全长基因,并用生物信息学方法对该蛋白的二级、高级结构和功能活性位点进行预测.[结果]克隆得到长784bp的甘蔗14-3-3基因,最大开放阅读框为771 bp,编码256个氨基酸;该蛋白的分子量与理论等电点分别为28.88 kDa和4.79.蛋白聚类分析结果表明,甘蔗14-3-3蛋白与水稻、高粱、玉米14-3-3蛋白的同源性均在90%以上.Cn3D V.4.1预测位于第3和第5两个二聚体上的Lys-50、Arg-57、Arg-131和Try-132组成一个凹穴,是结合靶蛋白的作用面;第60、65、188、218位的4个丝氨酸是磷酸化的活性位点.实时定量PCR检测结果表明,14-3-3基因在甘蔗不同组织中均有表达,在茎和分生组织中14-3-3基因高丰度表达,可能与糖代谢和细胞分裂的调控相关;而在根中可能参与矿物元素的吸收和代谢.[结论]甘蔗14-3-3基因可作为信号转导调控蛋白的候选基因之一.

关 键 词:甘蔗  14-3-3基因  聚类分析  蛋白结构  表达  实时定量PCR

Cloning and expression analysis of 14-3-3 gene from Saccharum spp.hybrids
LUO Lian-fang,KONG Ran,SU Jun-bo. Cloning and expression analysis of 14-3-3 gene from Saccharum spp.hybrids[J]. Guangxi Agricultural Sciences, 2013, 0(11): 1757-1764
Authors:LUO Lian-fang  KONG Ran  SU Jun-bo
Affiliation:1.South Subtropical Crop Research Institute, Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences, Zhanjiang, Guangdong 524091, China;)
Abstract:
Keywords:sugarcane  14-3-3 gene  cluster analysis  protein structure  expression  real-time quantitative PCR
本文献已被 维普 等数据库收录!
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