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与粳稻BT型细胞质育性恢复基因连锁的实用SSR标记的筛选
引用本文:程保山,洪德林,万志兵,郭媛.与粳稻BT型细胞质育性恢复基因连锁的实用SSR标记的筛选[J].南京农业大学学报,2011,34(1).
作者姓名:程保山  洪德林  万志兵  郭媛
作者单位:1. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏,南京,210095;江苏徐淮地区淮阴农业科学研究所/江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室,江苏,淮安,223001
2. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏,南京,210095
3. 南京农业大学作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏,南京,210095;黄山学院生命与环境科学学院,安徽,黄山,245001
基金项目:教育部长江学者和创新团队发展计划项目,教育部高等学校创新引智计划项目,江苏省环洪泽湖生态农业生物技术重点实验室开放基金资助项目,国家863计划项目
摘    要:以粳稻BT型细胞质育性恢复基因Rf-1位点的近等基因系、77个测交父本以及5个不育系与77个测交父本配制的178个测交组合F1为材料,利用义献报道的与Rf-1连锁的12对SSR标记引物,筛选近等基因系间与育性等位基因连锁带型一致的SSR标记,再用后者扩增测交父本,并调查测交F1植株的自然结实率,验证父本带型与育性恢复力的关系.结果表明:住12对SSR标记引物中,RM5629在六千辛A和六千辛B中均扩增出120 bp的片段,在恢复基因供体77302-1和8个近等基因系六千辛R株系中均扩增出110 bp的片段,在六千辛A/六千辛R的杂种F1中扩增出110 hp和120 bp的互补片段.6427 R系列、武育粳3号R系列、六盐189R系列、157TR系列、4016LHR系列、4016R和秀水04R同质恢复系以及8个常用的非同质恢复系的RM5629标记基因型与育性恢复力的符合率均为100%,3726R系列同质恢复系的标记基因型与育性恢复力的符合率为94.1%,平均为97.3% RM5629可作为Rf-1分子标记辅助选抒的实用SSR标记.

关 键 词:粳稻  恢复基因  近等基因系  SSR标记  分子标记辅助选择

Screening of applicable SSR marker linked to restorer gene for BT-type cytoplasm in japonica rice
CHENG Bao-shan,HONG De-lin,WAN Zhi-bing,GUO Yuan.Screening of applicable SSR marker linked to restorer gene for BT-type cytoplasm in japonica rice[J].Journal of Nanjing Agricultural University,2011,34(1).
Authors:CHENG Bao-shan  HONG De-lin  WAN Zhi-bing  GUO Yuan
Institution:CHENG Bao-shan1,2,HONG De-lin1,WAN Zhi-bing1,3,GUO Yuan1(1.State Key Laboratory of Crop Genetics and Germplasm Enhancement,Nanjing Agricultural University,Nanjing 210095,China,2.Huaiyin Institute of Agricultural Sciences of Xuhuai Region/Jiangsu Key Laboratory of Eco-AgriculturalBiotechnology around Hongze Lake,Huaian 223001,3.College of Life and EnvironmentalSciences,Huangshan University,Huangshan 245041,China)
Abstract:Applicable SSR marker linked to Rf-1,a restorer gene for BT-type cytoplasm in japonica rice(Oryza sativa L.),was screened and validated by using near isogenic lines,77 pollinators and 178 testcrosses F1 made from 5 cytoplasm male sterile(CMS)lines and the pollinators,and 12 pairs of SSR primers linked to Rf-1 reported in literatures.Among the 12 pairs of SSR primers used,RM5629 amplified a band of 120 bp in LiuqianxinA and LiuqianxinB,and a band of 110 bp among 8 iso-cytoplasmic restorer lines and 77302-1,t...
Keywords:japonica rice  restorer gene  near isogenic lines  SSR marker  molecular marker-assisted selection(MAS)  
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