糙皮侧耳PoLIM基因家族鉴定与表达分析 |
| |
引用本文: | 戚元成,王贺莲,申进文,文晴,胡延如,王风芹.糙皮侧耳PoLIM基因家族鉴定与表达分析[J].食用菌学报,2024(2):19-25. |
| |
作者姓名: | 戚元成 王贺莲 申进文 文晴 胡延如 王风芹 |
| |
作者单位: | 河南农业大学生命科学学院 |
| |
基金项目: | 河南省高等学校重点科研项目(24A180012);;国家自然科学基金(U1904112);;国家现代农业产业技术体系(CARS-20); |
| |
摘 要: | 在NCBI、JGI数据库中检索糙皮侧耳(Pleurotus ostreatus)PoLIMs,进行生物信息学分析;测定PoLIM 1~PoLIM 6在25℃培养7 d(菌丝期),16℃培养5 d(扭结前期)、10 d(扭结后期)、15 d(原基期)、22 d(子实体期)的相对表达量以及菌丝在4℃冷胁迫12、24、48 h的相对表达量。结果表明:PoLIM1~PoLIM6的氨基酸数量为353~1 673;等电点为7.26~9.98;亚细胞定位预测均在细胞核中;有10个保守基序;启动子序列中包含光、生长素、MYB转录因子以及低温胁迫等响应元件。就相对表达量而言,PoLIM1在子实体期较高;Po LIM2在扭结后期和子实体期较高;Po LIM3、Po LIM4、Po LIM6在菌丝期较高;Po LIM5在扭结后期较高,在原基期及子实体期降低。与对照(25℃)相比,4℃冷胁迫时Po LIM1、Po LIM3、Po LIM5、Po LIM6的相对表达量升高。
|
关 键 词: | 糙皮侧耳 LIM结构域 发育 qRT-PCR 冷胁迫 |
|
|