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利用WGCNA鉴定甘薯耐盐相关共表达网络及核心基因
引用本文:张毅,吴万亿,刘霞宇,张洁,唐锐敏,贾小云.利用WGCNA鉴定甘薯耐盐相关共表达网络及核心基因[J].河南农业科学,2021,50(6):16-27.
作者姓名:张毅  吴万亿  刘霞宇  张洁  唐锐敏  贾小云
作者单位:山西农业大学 生命科学学院,山西 太谷 030801;山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801
基金项目:国家重点研发计划;国家重点研发计划;基础研究项目;中央引导地方科技发展资金项目;山西省自然科学基金;山西省重点研发项目;领军人才项目;山西省高等学校科技创新项目
摘    要:为了挖掘甘薯耐盐基因,利用不同盐胁迫时间甘薯根系的转录组数据,选取在样本间表达量变异最大的前50%基因(共32147个),进行加权基因共表达网络分析(Weighted gene co-expression network analysis,WGCNA).结果表明,共构建了20个基因共表达模块,从中筛选出6个与甘薯盐胁迫...

关 键 词:甘薯  加权基因共表达网络分析(WGCNA)  盐胁迫  转录组  核心基因
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