| 梨Ty1-copia反转录转座子的克隆及IRAP分子标记体系的建立 |
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| 引用本文： | 周 鹏,张士伟,翟 锐,等.梨Ty1-copia反转录转座子的克隆及IRAP分子标记体系的建立[J].西北农林科技大学学报(社会科学版),2016,44(2):97-104. |
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| 作者姓名： | 周 鹏 张士伟 翟 锐 等 |
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| 作者单位： | 西北农林科技大学 园艺学院，农业部西北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,西北农林科技大学 园艺学院，农业部西北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室,西北农林科技大学 园艺学院，农业部西北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31171925）；高校基本科研业务费项目（ZD2013005） |
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| 摘 要： | 【目的】从早酥梨及其红皮芽变基因组中分离Ty1-copia反转录转座子全长序列,分析序列特点,并基于其中长末端重复序列(LTR)建立IRAP分子标记体系。【方法】以早酥梨及其红皮芽变和极早熟芽变植株叶片为试材,根据已知的Ty1-copia反转录转座子保守区域设计引物,利用同源克隆技术得到目的基因。根据基因两端LTR序列设计引物,建立IRAP分子标记体系,并对早酥梨及其芽变进行遗传分析。【结果】从早酥梨基因组中获得2条Ty1-copia反转录转座子全长序列,分别命名为PbTYZS1和PbTYZS2,长度分别是9 363和9 632bp。从红色芽变基因组中获得1条序列,命名为PbTYRM1,长度为9 652bp。经结构分析,获得的3条序列都是典型的Ty1-copia反转录转座子,但其开放阅读框(ORF)的完整性发生了变化。利用反转录转座子LTR保守区域设计引物成功建立了IRAP分子标记体系,早酥梨与红皮芽变的平均遗传距离为0.104,与极早熟芽变的遗传距离为0.115,并且早酥梨与极早熟芽变的多态性为20.41%,较之与红皮芽变的多态性(18.89%)更为丰富。【结论】早酥梨及其红皮芽变基因组中都含有完整结构的Ty1-copia反转录转座子,建立的IRAP分子标记体系可以得到清晰稳定的多态性指纹图谱。
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| 关 键 词： | 梨 芽变 反转录转座子 进化分析 IRAP |
| 收稿时间： | 2014/6/19 0:00:00 |
Cloning of Ty1-copia retrotransposons in pear (Pyrus bretschneideri Rehd.) and establishment of the inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) marker system |
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| ZHOU Peng,ZHANG Shi-wei and ZHAI Rui,et al.Cloning of Ty1-copia retrotransposons in pear (Pyrus bretschneideri Rehd.) and establishment of the inter-retrotransposon amplified polymorphism (IRAP) marker system[J].Journal of Northwest Sci-Tech Univ of Agr and,2016,44(2):97-104. |
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| Authors: | ZHOU Peng ZHANG Shi-wei and ZHAI Rui |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | pear bud mutant retrotransposon phylogenetic analysis IRAP |
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