威宁绵羊和贵州半细毛羊FecB 基因SNP 分析 |
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引用本文: | 王 振,申小云,盘道兴,谢海强,刘若余. 威宁绵羊和贵州半细毛羊FecB 基因SNP 分析[J]. 广东农业科学, 2016, 43(1): 130-135. DOI: 10.3969/j.issn.1004-874X.2016.01.024 |
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作者姓名: | 王 振 申小云 盘道兴 谢海强 刘若余 |
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作者单位: | 1. 贵州大学动物科学学院/贵州大学高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州贵阳,550025;2. 贵州省扶贫办公室外资项目管理中心,贵州贵阳550004;西南科技大学生命科学院,四川绵阳621010 |
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基金项目: | 贵州省优秀教育人才省长专项(黔省专合字[2009]129),国家现代农业产业技术体系(CARS-40-30) |
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摘 要: | 利用威宁绵羊和贵州半细毛羊构建DNA池,设计11对引物扩增其Fec B基因外显子和部分内含子的序列,对纯化后的PCR产物双向测序,分析确定多态性位点。然后利用生物信息学软件分析SNPs位点对Fec B基因RNA二级结构、Fec B蛋白结构的影响。结果显示,在扩增的Fec B基因中筛选到10个SNPs,其中exon5-A39G、exon9-C37A、exon11-C87A、intron2-A62G、intron4-A1023G、intron10-G24A突变为威宁绵羊和贵州半细毛羊中所共有,而exon9-A8G和intron1-G243A突变为威宁绵羊所特有,intron3-G177A和exon8-T86C突变为贵州半细毛羊所特有。上述的SNPs中,exon5-A39G和exon9-A8G为错义突变,exon5-A39G突变导致编码的异亮氨酸(Ile)变为缬氨酸(Val),exon9-A8G突变导致编码的天冬酰胺(Asn)变为天冬氨酸(Asp);exon9-C37A和exon11-C87A多态位点均未改变氨基酸的编码,为同义突变。
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关 键 词: | FecB基因 威宁绵羊 贵州半细毛羊 单核苷酸多态性(SNP) |
SNP analysis of FecB in Guizhou semi-fine wool sheep and Weining sheep |
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Abstract: | |
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