| 捻转血矛线虫耐药虫株与敏感虫株circRNAs差异表达分析 |
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| 引用本文： | 寇慧林,陈昕迪,王腾宇,高娃,温海峰,张艳敏,于宇,李峥,刘春霞,王文龙. 捻转血矛线虫耐药虫株与敏感虫株circRNAs差异表达分析[J]. 中国农业大学学报, 2024, 0(2): 122-130 |
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| 作者姓名： | 寇慧林 陈昕迪 王腾宇 高娃 温海峰 张艳敏 于宇 李峥 刘春霞 王文龙 |
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| 作者单位： | 1.内蒙古农业大学 兽医学院/农业农村部动物疾病临床诊疗技术重点实验室,呼和浩特 010010;2.河套学院 医学系/内蒙古自治区蜱媒人畜共患传染病重点实验室,内蒙古 巴彦淖尔 015000;3.内蒙古农业大学 生命科学学院,呼和浩特 010010 |
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| 基金项目： | 内蒙古自然科学基金项目（2020MS03012）；“科技兴蒙”行动重点专项（NMKJXM202203-5） |
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| 摘 要： | 为分析捻转血矛线虫伊维菌素敏感虫株与耐药虫株之间差异表达的circRNAs在调控耐药性中的作用，本研究以捻转血矛线虫敏感虫株和耐药虫株为研究对象，采用Illumina Hiseq 2 000平台进行高通量测序及cDNA文库的构建，利用相关生物信息学软件对测得的circRNAs进行差异性分析，同时对来源基因进行GO和KEGG pathway功能富集。运用TargetScan和Miranda软件预测关键circRNAs靶向的miRNAs，探究circRNAs-miRNAs的作用。随后又随机选取5个显著差异的circRNAs，进行RT-qPCR检测并与转录组测序结果进行一致性评定。结果显示：1）敏感虫株与耐药虫株共筛选出677个差异表达的circRNAs，其中47个显著差异，23个显著上调，24个显著下调。2）所有差异circRNAs的来源基因GO富集分析显示，共富集到生物过程336个、细胞组分59个和分子功能110个，主要与代谢过程、细胞膜结构和催化活性等相关；KEGG富集分析显示，富集到257条通路，主要与代谢（脂肪酸生物合成、甘油磷脂代谢和丙酸代谢）、胰高血糖素信号通路和AMPK信号通...
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| 关 键 词： | 捻转血矛线虫 伊维菌素 耐药性 转录组 circRNAs 差异分析 |
| 收稿时间： | 2023-06-07 |
Differential expression of circRNAs in resistant and sensitive strains of Haemonchus contortus |
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| KOU Huilin,CHEN Xindi,WANG Tengyu,GAO W,WEN Haifeng,ZHANG Yanmin,YU Yu,LI Zheng,LIU Chunxi,WANG Wenlong. Differential expression of circRNAs in resistant and sensitive strains of Haemonchus contortus[J]. Journal of China Agricultural University, 2024, 0(2): 122-130 |
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| Authors: | KOU Huilin CHEN Xindi WANG Tengyu GAO W WEN Haifeng ZHANG Yanmin YU Yu LI Zheng LIU Chunxi WANG Wenlong |
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| Affiliation: | 1.Key Laboratory of Clinical Diagnosis and Treatment Technology in Animal Disease of Ministry of Agriculture/College of Veterinary Medicine, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010010, China;2.Inner Mongolia Key Laboratory of Tick-borne Zoonotic Infectious Disease, Department of Medicine/Hetao College, Inner Mongolia Bayannur 015000, China;3.College of Life Science, Inner Mongolia Agricultural University, Hohhot 010010, China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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