| 团头鲂低氧耐受相关SNPs标记的开发 |
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| 引用本文： | 陈柏湘,王伟峰,王卫民,王焕岭. 团头鲂低氧耐受相关SNPs标记的开发[J]. 华中农业大学学报, 2019, 38(2): 23-29 |
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| 作者姓名： | 陈柏湘 王伟峰 王卫民 王焕岭 |
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| 作者单位： | 华中农业大学水产学院,武汉 430070;广东佛山市南海百容水产良种有限公司,佛山 528216;华中农业大学水产学院,武汉,430070 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目（31872542）；中央高校基本业务费专项（2013PY067） |
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| 摘 要： | 为寻找耐低氧相关SNPs分子标记辅助团头鲂优良品种选育,利用团头鲂低氧耐受和敏感群体的转录组数据,进行SNPs位点的开发和鉴定,获得52 623个可能的SNPs位点,其中碱基转换和颠换型位点分别占57.4%(30 192个)和31.9%(16 802个);同义SNPs占编码区总SNPs的99.7%,非同义SNPs仅有32～35个;使用PCR-RFLP技术对筛选出的5个非同义的多态性SNPs进行耐低氧性状关联分析。结果显示,Plin2-A1157G和Hif-3α-A2917G位点的SNPs在团头鲂亲本群体中与低氧耐受性状显著相关,但在子代群体中却与低氧耐受性状无显著相关性。这说明亲代中筛选出的分子标记并不一定适用于子代群体,在利用分子标记辅助育种时需要考虑标记在子代中的有效性。
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| 关 键 词： | 团头鲂 低氧 SNP 性状关联分析 |
| 收稿时间： | 2018-11-05 |
Isolation of SNP markers associated with hypoxia tolerance in Megalobrama amblycephala |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Megalobrama amblycephala hypoxia SNP trait association |
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