利用PCR产物混池重测序检测梨褐皮关联SLAF标签多态性

在已知梨褐皮关联的SLAF标签（Marker286117）序列上存在4个SNP位点，共有4个基因型（a～d）的基础上，使用PCR加混池重测序技术鉴定该SLAF标签在64个梨品种中的多态性。共获得7.1 Gb原始数据，通过编译的SNP-rseq和Calculate程序对数据进行处理，64个梨样品获得的平均read数量为117 642条，满足分析需求。在该SLAF标签上新发现2个基因型（e和f）。6个基因型中c为原始类型，在栽培种砂梨和白梨中鉴定到b、d和e基因型；a和f基因型则出现在拥有西方梨血统的样品中。对基因型和表型统计后发现，c基因型存在时，梨果皮为褐色，不含c基因型时为绿色。该规律不仅适用于东方梨，在西方梨的一些样品中也适用。混池重测序技术降低了测序成本，相关技术手段能够应用于简化重测序后续的验证和标记辅助育种。