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柑橘黄龙病菌原噬菌体的遗传多样性分析
引用本文:游平,杨进,周俊,黄爱军,鲍敏丽,易龙.柑橘黄龙病菌原噬菌体的遗传多样性分析[J].园艺学报,2024(4):727-736.
作者姓名:游平  杨进  周俊  黄爱军  鲍敏丽  易龙
作者单位:1. 赣南师范大学生命科学学院;2. 国家脐橙工程技术研究中心
基金项目:江西省科技项目(20225BCJ22005);;国家自然科学基金项目(32160625);;国家重点研发计划项目(2021YFD1400805);
摘    要:以采自广东、广西、海南、云南、四川、贵州等6个地区共300份感染柑橘黄龙病菌的DNA样本作为试验材料,通过PCR技术对黄龙病菌携带的3种类型原噬菌体基因进行特异扩增、测序,利用相关生物信息学软件进行遗传多样性分析。结果共鉴定出8种原噬菌体组合;携带单一原噬菌体类型的黄龙病菌株为6个地理种群的优势菌株,占比53.3%,其中以Type 2型为主;3类原噬菌体基因位点中A+T含量均高于G+C,表现出AT偏好特点;重组分析结果显示黄龙病菌间无重组信号,表明未发生重组事件;基因流Nm值均大于1,说明黄龙病菌在各种群中基因交流频繁;中性检验结果显示Tajima’s D、Fu and Li’s D、Fu and Li’s F值均小于0,表明黄龙病菌种群存在过历史扩张。

关 键 词:柑橘  黄龙病  原噬菌体  遗传多样性
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