全基因组鉴定和表达模式分析玉米AP2转录因子 |
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引用本文: | 郭海滨,郝立冬,魏雅冬.全基因组鉴定和表达模式分析玉米AP2转录因子[J].分子植物育种,2021,19(5):1402-1408. |
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作者姓名: | 郭海滨 郝立冬 魏雅冬 |
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作者单位: | 绥化学院农业与水利工程学院,绥化,152061 |
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基金项目: | 黑龙江省省属高等学校基本科研业务费优秀创新团队建设项目(KYYWF10236190302);黑龙江省省属高等学校基本科研业务费青年项目(KYYWF10236180111)共同资助。 |
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摘 要: | AP2属于AP2/ERF转录因子家族中的一个亚族,其主要特征是具有2个独立的AP2/ERF结构域。本研究利用生物信息学的方法在玉米基因组中鉴定到22个玉米AP2转录因子,并对其理化性质、基因结构、保守基序、系统进化关系和表达模式进行了分析。结果表明,玉米AP2家族成员的理化性质差异较大,且都属于亲水性蛋白。系统进化分析表明玉米AP2家族基因被分为euANT、baselANT、euAP2三个亚组,相同亚组的基因具有相似的基因结构和保守基序。共线性分析发现玉米AP2家族基因中不存在基因串联重复事件,只存在两对片段复制事件,同时结果表明禾本科AP2家族基因之间具有很好的共线性关系。表达模式分析发现ZmAP2基因广泛参与植物的生长发育。转录组数据分析发现,在盐胁迫下一共鉴定到16个ZmAP2基因。本研究为进一步研究玉米AP2转录因子家族的生物学功能提供了科学依据。
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关 键 词: | AP2 玉米 盐胁迫 转录因子 表达分析 |
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