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苦荞14-3-3基因家族生物信息学分析
作者单位:湖南农业大学,湖南省农业大数据分析与决策工程技术研究中心,长沙,410128;云南农业大学,省部共建云南生物资源保护与利用国家重点实验室,昆明,650201
基金项目:湖南省大学生研究性学习和创新性实验计划;湖南省教育厅科学研究项目
摘    要:14-3-3蛋白是普遍存在于真核细胞中的蛋白质,在植物的生长发育、信号传导、抵御胁迫等方面发挥着重要的作用,编码14-3-3蛋白的基因以基因家族的形式存在。本试验利用BLASTp从苦荞全基因组中查找到19个14-3-3基因家族成员,其编码蛋白中ε类蛋白序列8条,非ε类蛋白序列11条。利用生物信息学软件对14-3-3蛋白的氨基酸序列进行理化性质分析,发现它们的长度介于101~242 aa,等电点范围为4.27~9.59,大部分表现为酸性亲水蛋白,通过亚细胞定位预测其存在于细胞质、叶绿体、胞外、细胞核和细胞骨架中。通过对苦荞14-3-3蛋白的结构分析,发现该蛋白以α-螺旋、延伸链、无规则卷曲为主来维持蛋白质结构的相对稳定性且蛋白质序列高度保守,共含有8个保守基序,分布在7条染色体上。根据苦荞14-3-3蛋白的理化性质、结构、进化等方面的分析对其功能进行了初步的预测,推测苦荞14-3-3蛋白在靶蛋白亚细胞定位、基因转录、物质跨膜运输、非生物胁迫、代谢调控中发挥着重要的作用。本研究为后续苦荞14-3-3蛋白复杂结构和生物学功能等方面的深入研究提供科学依据。

关 键 词:苦荞(Fagopyrum  tataricum)  14-3-3基因家族  生物信息学分析
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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