日本蛇根草转录组数据的功能注释及SSR标记开发 |
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作者姓名: | 张子楠 张潮 唐汉青 相孟达 董溪 汤晓辛 |
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作者单位: | 贵州师范大学生命科学学院,西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业局重点实验室,贵阳,550001;贵州师范大学生命科学学院,西南喀斯特山地生物多样性保护国家林业局重点实验室,贵阳,550001;贵州师范大学,贵州省植物生理与发育调控重点实验室,贵阳,550001 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;贵州省科技合作计划项目;贵州师范大学博士科研启动基金;共同资助 |
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摘 要: | 日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica)具有很好的观赏价值和药用价值,但基因组信息相对缺乏,导致其分子生物学和基因功能的研究受到限制.为了获得和挖掘日本蛇根草的基因数据和功能,本研究利用日本蛇根草RNA-seq转录组数据进行分析,总共产生8.48 GB数据;对所有单基因在KEGG通路数据库进行分析,共有1...
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关 键 词: | 日本蛇根草(Ophiorrhiza japonica) 转录组 SSR 生物信息学 功能注释 |
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