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油棕Aux/IAA基因家族鉴定与生物信息学分析
作者单位:海南大学热带作物学院,海口,570228;中国热带农业科学院椰子研究所,海南省热带油料作物生物学重点实验室,文昌,571339;中国热带农业科学院椰子研究所,海南省热带油料作物生物学重点实验室,文昌,571339;海南大学热带作物学院,海口,570228;海南大学园艺学院,海口,570228
基金项目:印度尼西亚开展热带作物生产技术示范项目
摘    要:Aux/IAA基因家族是植物激素生长素(Auxin)早期反应的三大家族之一,研究Aux/IAA基因家族有利于深入探讨生长素信号转导分子机制,而油棕Aux/IAA基因家族的全基因组分析尚无报道。本研究利用生物信息学方法在油棕中鉴定到55个Aux/IAA家族基因,染色体定位分析表明其中50个分布在油棕的除第5、第13、第14、第15染色体外的不同染色体上;聚类分析将油棕Aux/IAA分为A、B两大类群,8个亚族;分析油棕Aux/IAA基因的表达模式,表明其Aux/IAA基因家族不同亚族基因的表达模式存在较大差异,其中一些基因可能与油棕的授粉受精过程相关。本研究将为油棕Aux/IAA基因家族各基因的具体功能研究提供一定的理论依据,并对油棕育种研究和高产栽培提供一定的参考。

关 键 词:油棕  Aux/IAA基因家族  生物信息学
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