基于转录组的巨龙竹CesA基因家族的生物信息学分析 |
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引用本文: | 王文治,王娟,王昌命,潘悦,宋静,栗宏林.基于转录组的巨龙竹CesA基因家族的生物信息学分析[J].分子植物育种,2021,19(9):2912-2921. |
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作者姓名: | 王文治 王娟 王昌命 潘悦 宋静 栗宏林 |
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作者单位: | 西南林业大学生命科学学院,昆明,650224;西南林业大学,绿色发展研究院,昆明,650224;西南林业大学林学院,昆明,650224;西南林业大学园林园艺学院,昆明,650224 |
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基金项目: | 云南省重大基础专项生物资源数字化开发应用项目;领军人才项目;国家重点实验室开放基金 |
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摘 要: | 纤维素是植物细胞壁的重要组成成分,主要由多个纤维素合成酶(CesA)基因家族参与编码.本研究基于巨龙竹单分子实时测序(SMRT)转录组数据库,利用高质量转录本非冗余序列结合转录本功能注释,共筛选出45个CesA基因候选序列.巨龙竹CesA基因家族编码蛋白的氨基酸数目为351~1 652个,其分子量为40.45~186....
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关 键 词: | 巨龙竹(Dendrocalamus sinicus) 纤维素合成酶 转录组 生物信息学 |
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