| 利用16S rDNA结合gyrA和gyrB基因对生防芽孢杆菌R31的快速鉴定 |
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| 引用本文： | 喻国辉,牛春艳,陈远凤,陈燕红,杨紫红.利用16S rDNA结合gyrA和gyrB基因对生防芽孢杆菌R31的快速鉴定[J].中国生物防治,2010,26(2):160-166. |
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| 作者姓名： | 喻国辉 牛春艳 陈远凤 陈燕红 杨紫红 |
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| 作者单位： | 1. 珠海市农业科学研究中心,珠海,519075
2. 珠海市农业科学研究中心,珠海,519075;中山大学生命科学学院,广州,510275 |
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| 基金项目： | 广东省科技厅教育部产学研结合项目(2007B090400083); 珠海市产学研结合项目(PC20082043); 珠海市科技计划项目(PC20081078) |
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| 摘 要： | 克隆16S rDNA、DNA促旋酶A亚基编码基因gyrA和B亚基编码基因gyrB对分离自石斛兰（Dendrobiumsp.）叶片的广谱抗真菌生防芽孢杆菌R31进行鉴定。首先通过生理生化测定和克隆16S rDNA序列,分析显示其属于芽孢杆菌属（Bacillus）,但不能准确鉴定到种;然后分别利用克隆的gyrA基因和gyrB基因以及其BLAST分析结果构建系统发育树,最终将该菌株确定为枯草芽孢杆菌（B.subtilis）。结果显示利用16S rDNA与gyrA基因组合可以快速鉴定枯草芽孢杆菌,利用16S rDNA与gyrB基因组合可以快速鉴定枯草芽孢杆菌及其近缘种。
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| 关 键 词： | 芽孢杆菌 16S rDNA gyrA基因 gyrB基因 鉴定 |
Use of 16S rDNA,gyrA and gyrB Gene Sequence to Identify a Biocontrol Bacillus sp. Strain R31 |
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| YU Guo-hui
,
NIU Chun-yan
,
CHEN Yuan-feng
,
CHEN Yan-hong
,
YANG Zi-hong.Use of 16S rDNA,gyrA and gyrB Gene Sequence to Identify a Biocontrol Bacillus sp. Strain R31[J].Chinese Journal of Biological Control,2010,26(2):160-166. |
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| Authors: | YU Guo-hui NIU Chun-yan CHEN Yuan-feng CHEN Yan-hong YANG Zi-hong |
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| Institution: | YU Guo-hui1,NIU Chun-yan1,2,CHEN Yuan-feng1,CHEN Yan-hong1,YANG Zi-hong1(1.Zhuhai Agricultural Science Research Center,Zhuhai 519075,2.College of Life Science,Sun Yat-sun University,Guangzhou 510275,China) |
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| Abstract: | BLAST analysis based on 16S rDNA sequence gave information that strain R31 was a strain of Bacillus.Even combined with the information about physiological and biochemical characteristics,the exact species could not be identified.Furthermore,gyrA gene and gyrB gene,which encode the subunit A and B of DNA gyrase,respectively,were cloned and used to identify the strain R31.Phylogenetic tree based on the BLAST results with gyrA gene sequence or gyrB gene sequence could identify strain R31 as B.subtilis.Combinat... |
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| Keywords: | Bacillus 16S rDNA gyrA gene gyrB gene identification |
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