猪流行性腹泻病毒CH-HeNXX-2017株全基因组序列测定与分析 |
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引用本文: | 焦文强,许峰,徐引弟,王治方,张青娴,王克领,朱文豪,李海利,张立宪,郎利敏. 猪流行性腹泻病毒CH-HeNXX-2017株全基因组序列测定与分析[J]. 山西农业科学, 2019, 0(1) |
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作者姓名: | 焦文强 许峰 徐引弟 王治方 张青娴 王克领 朱文豪 李海利 张立宪 郎利敏 |
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作者单位: | 河南省农业科学院畜牧兽医研究所;河南省畜禽繁育与营养调控重点实验室 |
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摘 要: | 为了解猪流行性腹泻病毒在河南流行毒株全基因组遗传进化水平,应用RT-PCR方法从疑似猪流行性腹泻病毒感染的病料中扩增出全基因组序列,并将PCR产物纯化后连接pMD20-T载体,转化JM109感受态细胞,挑选单克隆进行测序,获得的序列经过DNA STAR中Edit Sequence软件对全基因组序列进行拼接。结果表明,猪流行性腹泻病毒CH-He NXX-2017株全长28 038 nt(除去poly A);进化树分析显示,该毒株与IA1,USA Colorado2013,MN和PC22A等毒株亲缘关系较为接近,与国内外早期分离株如CV777,LZC,DR13等毒株亲缘关系较远。揭示猪流行性腹泻病毒一直处于不断的进化中,需要一直密切监控病毒进化趋势,为临床诊断以及疫苗研发等提供理论参考。
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关 键 词: | 猪流行性腹泻病毒 CH-He NXX-2017株 全基因组序列 |
Complete Genome Sequence Determination and Phylogenetic Analysis of Porcine Epidemic Diarrhea Virus CH-HeNXX-2017 Strain |
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