首页 | 本学科首页   官方微博 | 高级检索  
     检索      

蒙古黄芪异黄酮合成酶基因密码子偏好性分析
引用本文:冯瑞云,田翔,程宏,王慧杰,梅超,左敏,雷梦林.蒙古黄芪异黄酮合成酶基因密码子偏好性分析[J].山西农业科学,2019(3):297-303.
作者姓名:冯瑞云  田翔  程宏  王慧杰  梅超  左敏  雷梦林
作者单位:山西省农业科学院作物科学研究所作物遗传与分子改良山西省重点实验室;山西省农业科学院农作物品种资源研究所农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室;山西省农业科学院玉米研究所
摘    要:异黄酮是只局限于豆科蝶形花亚科等极少数植物中的一种植物性雌激素,异黄酮合成酶(IFS)是苯丙氨酸分支代谢途径——异黄酮代谢途径的关键酶。为了解蒙古黄芪IFS基因密码子的使用特性,采用CodonW,SPSS软件及EMBOSS在线程序分析蒙古黄芪IFS基因密码子的偏好性,并分别与14个物种的IFS以及模式生物基因组进行比较。结果显示,蒙古黄芪IFS基因的密码子选择偏性较弱且较偏好以A/T结尾,而物种间IFS密码子选择偏性则存在一定差异;进化树分析表明,基于IFS编码序列聚类结果比密码子使用偏性分类结果能更准确地反映物种间的亲缘关系;密码子使用频率比较结果发现,酵母真核表达系统更适用于蒙古黄芪IFS基因异源表达系统建立,而蒙古黄芪IFS基因与模式植物基因组之间密码子使用偏性差异较小,尤其拟南芥可能为该基因转基因研究最为理想的受体。

关 键 词:蒙古黄芪  密码子偏好性  异黄酮合成酶  聚类分析

Analysis of Codon Bias of IFS Gene in Astragalus. membranaceus var. mongholicus
Abstract:
Keywords:
本文献已被 CNKI 等数据库收录!
设为首页 | 免责声明 | 关于勤云 | 加入收藏

Copyright©北京勤云科技发展有限公司  京ICP备09084417号