谷子和狗尾草WOX转录因子基因的全基因组鉴定与分析 |
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引用本文: | 李雪垠,武懿茂,张凤洁.谷子和狗尾草WOX转录因子基因的全基因组鉴定与分析[J].山西农业科学,2019(6):957-962. |
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作者姓名: | 李雪垠 武懿茂 张凤洁 |
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作者单位: | 山西农业大学生命科学学院;山西农业大学农学院 |
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摘 要: | WOX转录因子主要功能涉及植物组织发育、器官形成和干细胞维持等。为了深入研究谷子和狗尾草WOX转录因子基因家族,为后续狗尾草属植物生长发育相关WOX基因的克隆和功能研究奠定理论基础,研究鉴定了谷子和狗尾草WOX转录因子家族基因,并进行了生物信息学分析。结果表明,谷子和狗尾草基因组分别包含13,12个WOX基因,谷子和狗尾草共有12对直系同源基因,这些同源基因具有相似的基因结构,谷子和狗尾草WOX基因内含子相位为0或1;谷子和狗尾草WOX基因蛋白质基序Motif 1,Motif 3,Motif 4和Motif 5较为保守;SiWOX1等基因启动子包含AACA_motif,CAT-box,GCN4_motif,RY-element等元件,说明它们可能参与调控胚乳或种子发育、或分生组织形成;SiWOX11和SvWOX10这2个基因在根组织中表达量非常高,说明这2个基因可能与根系发育密切相关。
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关 键 词: | 谷子 狗尾草 WOX 转录因子 生物信息学 基因表达 |
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