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谷子和狗尾草WOX转录因子基因的全基因组鉴定与分析
引用本文:李雪垠,武懿茂,张凤洁.谷子和狗尾草WOX转录因子基因的全基因组鉴定与分析[J].山西农业科学,2019(6):957-962.
作者姓名:李雪垠  武懿茂  张凤洁
作者单位:山西农业大学生命科学学院;山西农业大学农学院
摘    要:WOX转录因子主要功能涉及植物组织发育、器官形成和干细胞维持等。为了深入研究谷子和狗尾草WOX转录因子基因家族,为后续狗尾草属植物生长发育相关WOX基因的克隆和功能研究奠定理论基础,研究鉴定了谷子和狗尾草WOX转录因子家族基因,并进行了生物信息学分析。结果表明,谷子和狗尾草基因组分别包含13,12个WOX基因,谷子和狗尾草共有12对直系同源基因,这些同源基因具有相似的基因结构,谷子和狗尾草WOX基因内含子相位为0或1;谷子和狗尾草WOX基因蛋白质基序Motif 1,Motif 3,Motif 4和Motif 5较为保守;SiWOX1等基因启动子包含AACA_motif,CAT-box,GCN4_motif,RY-element等元件,说明它们可能参与调控胚乳或种子发育、或分生组织形成;SiWOX11和SvWOX10这2个基因在根组织中表达量非常高,说明这2个基因可能与根系发育密切相关。

关 键 词:谷子  狗尾草  WOX  转录因子  生物信息学  基因表达
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