| 猪传染性胃肠炎病毒SCY株3′端8．5kb片段的克隆及序列特征分析 |
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| 作者姓名： | 殷华平 郭万柱 宋振辉 孙志勇 徐志文 王小玉 陈进会 杨丽 |
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| 作者单位： | [1]四川农业大学动物生物技术中心,雅安625014 [2]广东东莞市出入境检验检疫局,东莞523072 [3]四川农业大学动物科技学院,雅安625014 |
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| 基金项目： | 教育部长江学者和创新团队发展计划（IRT0555） |
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| 摘 要： | 根据GenBank的核酸序列，设计6对引物自TGEV SCY株中分别扩增了长为1．5kb、2．0kb、1．1kb、1．4kb、1．4kb、1．3kb的6个片段，经克隆测序拼接后获得8495bp的TGEV部分序列。根据与其他TGEV和冠状病毒的序列和结构特征比较表明，该段序列克隆了除TGEV聚合酶基因以外的S、M、N、E、NSP3a、NSP3b、ORF7共7个基因的核酸序列；根据S、M、N基因的序列构建了系统进化树，分析表明TGEV-SCY株与TS、HN2002、TO14、pudue等毒株亲缘关系较近；密码子偏爱性分析结果认为TGEV在对密码子的使用上存在轻微的偏向性，个别氨基酸偏向于选择以A和T结尾的密码子。
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| 关 键 词： | 猪传染性胃肠炎病毒（TGEV） M基因 S基因 N基因 克隆 生物信息学 |
| 文章编号： | 0366-6964（2007）01-0066-06 |
| 修稿时间： | 2006-04-08 |
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