牛冠状病毒河北流行株部分基因全序列测定及分子特征分析

牛冠状病毒（BCoV）是引起新生犊牛腹泻的重要病原之一，在世界范围内广泛分布，严重影响养牛业的健康发展。为确定河北省BCoV流行毒株的基因遗传进化特征，本研究对从河北省某牛场腹泻犊牛的粪便和肠内容物中鉴定出的1株BCoV流行毒株（BCoV/CH/HB-BD/2019），进行了S、N、HE基因的全序列扩增及测定，并与GenBank中的51株牛冠状病毒参考株进行了各基因的同源性和遗传进化分析。结果显示：BCoV/CH/HB-BD/2019与BCoV参考株相比，S基因具有2个独特的氨基酸变异位点（N311S、D1276Y）；在HE基因中HB-BD株出现2个独特的氨基酸变异位点，分别为G400V、D423H；虽然在基因的重组分析中，HB-BD株HE基因序列并没有检测到基因重组信号，但通过检测我们发现，HB-BD株HE基因序列为其新疆毒株（KU886219.1）推测的主要亲本毒株；进化分析发现，BCoV HB-BD株与人冠状病毒（HCoV-OC43）均属于β类冠状病毒属2a亚群，且同源性高达96.0%，而正在全世界范围内传播的SARS-CoV-2属于β类冠状病毒属2b亚群病毒，BCoV与SARS...