正交设计优化崇明白山羊SSR-PCR反应体系 |
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引用本文: | 罗倩倩,张小平,刘志学,成建忠,黄松明,陈士超.正交设计优化崇明白山羊SSR-PCR反应体系[J].中国畜牧杂志,2010,46(15). |
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作者姓名: | 罗倩倩 张小平 刘志学 成建忠 黄松明 陈士超 |
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作者单位: | 1. 安徽师范大学生命科学学院,安徽芜湖,241000 2. 同济大学生命科学与技术学院,上海,200092 3. 上海市崇明县动物疫病预防控制中心,上海,202100 |
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基金项目: | 上海市生态崇明重大科技攻关专项项目,国家"863"计划重点项目 |
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摘 要: | 以崇明白山羊基因组DNA为模板,利用正交试验设计L16(45),对影响崇明白山羊SSR-PCR反应体系的5个因素(Taq酶、Mg2+、模板DNA、dNTP及引物的浓度)进行优化。结合单因素完全随机试验筛选各因素的最佳水平,针对MCB3224引物建立了崇明白山羊SSR-PCR的最佳反应体系。结果表明:在20μL的反应体系中,5个因素的最佳水平分别为Taq DNA聚合酶0.5 U、Mg2+2.5 mmol/L、模板DNA 30 ng、dNTP 0.20 mmol/L,引物0.8 mol/L;引物的最佳退火温度为57.3℃。利用16份崇明白山羊的DNA模板和2个微卫星引物验证此反应体系,聚丙烯酰胺凝胶电泳,结果显示该体系稳定可靠且普适性较好。
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关 键 词: | SSR-PCR 正交设计 体系优化 山羊 |
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