水稻OsRLCK167基因的组织表达模式和生物信息学分析 |
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作者姓名: | 马银花 刘桃梅 万天雪 肖新波 胡琼 李萍芳 段仁燕 张斌 金晨钟 杜波 |
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作者单位: | 湖南人文科技学院农业与生物技术学院,湖南 娄底 417000;武汉大学生命科学学院/杂交水稻国家重点实验室,湖北 武汉 430072 |
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基金项目: | 湖南省重点研发计划项目(2021NK2030);;湖南省自然科学基金面上项目(2021JJ30376); |
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摘 要: | 类受体胞质激酶(receptor-like cytoplasmic kinases, RLCKs)家族是一类特殊蛋白激酶,在植物生长和病原菌防御中发挥着重要的生物学功能。在对水稻RLCKⅥ家族成员OsRRK1基因的研究中发现水稻4号染色体上存在一个与其同源性特别高的基因,即OsRLCK167(LOC_Os04g56060)。为了丰富类受体胞质激酶家族并探究水稻胞质受体激酶基因的作用,本研究利用ExPASy-Protparam、Protscale、CD-search等在线工具和DNAMAN软件对OsRLCK167基因进行生物信息学分析;采用qRT-PCR技术对OsRLCK167基因做组织表达模式分析。结果显示:OsRLCK167蛋白的分子量为43.77776 kD,为疏水性、不稳定的酸性蛋白;对该蛋白的二级结构进行预测,显示其主要由无规则卷曲(41.94%)、α-螺旋(35.29%)、延伸链(15.35%)和β-转角(7.42%)组成;该基因在水稻不同组织均有表达,且在叶鞘中的表达量最高。结果表明,OsRLCK167基因在进化过程中具有高度的保守性,在水稻中具有功能多样性。
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关 键 词: | 水稻 OsRLCK167基因 组织表达模式 生物信息学分析 |
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