基于ITS 2序列的肉苁蓉种子DNA条形码鉴定研究 |
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引用本文: | 朱文娟,郭晔红,毕晓静,姚戈,李君臣.基于ITS 2序列的肉苁蓉种子DNA条形码鉴定研究[J].种子,2023(1):1-6. |
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作者姓名: | 朱文娟 郭晔红 毕晓静 姚戈 李君臣 |
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作者单位: | 1. 甘肃农业大学农学院省部共建干旱生境作物学国家重点实验室;2. 国民核生化灾害防护国家重点实验室 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31860349);;甘肃省科技计划资助项目(18 YF 1 NA 072); |
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摘 要: | 本研究基于ITS 2序列,对肉苁蓉和管花肉苁蓉的种子进行鉴定研究,旨在建立肉苁蓉种子的DNA条形码鉴定方法。通过提取种子的基因组DNA,经PCR扩增和双向测序,获得ITS 2序列。应用MEGA-X软件进行序列比对,计算K 2 P遗传距离,构建系统发育树。结果表明,所有种子样本均可以成功提取DNA和扩增ITS 2序列,种子的DNA分子量为10 000 bp左右,扩增产物为500 bp左右。肉苁蓉种子的ITS 2序列长度为414~472 bp, GC含量为54.41%~55.07%;管花肉苁蓉种子的ITS 2序列长度为399~489 bp, GC含量为54.18%~55.14%。肉苁蓉种子和管花肉苁蓉种子的ITS 2序列共有61个差异位点,种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离,二者在系统发育树中分别聚为一支。ITS 2序列可以作为肉苁蓉种子的DNA条形码鉴定序列。
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关 键 词: | 肉苁蓉 种子 ITS 2分子鉴定 DNA条形码 |
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