基于网络药理学和分子对接探究杜仲防治骨质疏松作用机制 |
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引用本文: | 曲永嘉,孙晓伟,周国兴,程远志,戴鸿哲,李洪涛.基于网络药理学和分子对接探究杜仲防治骨质疏松作用机制[J].特产研究,2023(1):39-49. |
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作者姓名: | 曲永嘉 孙晓伟 周国兴 程远志 戴鸿哲 李洪涛 |
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作者单位: | 1. 黑龙江中医药大学;2. 黑龙江中医药大学附属第一医院;3. 哈尔滨工业大学计算学部;4. 哈尔滨工业大学土木工程学院 |
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基金项目: | 黑龙江省博士后科研启动基金(LBH-Q19182); |
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摘 要: | 本研究运用网络药理学和分子对接的分析方法,探究杜仲防治骨质疏松的分子作用机制。通过TCMSP、GeneCards、OMIM以及DrugBank数据库分别对杜仲的入血有效活性成分、作用靶点以及与骨质疏松有关的疾病靶点进行汇总与筛选。将杜仲的有效活性成分与作用靶点经Cytoscape处理建立起药物靶点的网络关系图,找到药物疾病的共同作用靶点;通过STRING平台建立这些靶点的蛋白质言进行关键靶点的基因本体(Gene Ontology, GO)功能和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析,并将分析数据可视化,最后利用AutoDock进行分子对接验证。结果显示筛选后共得到25个杜仲的有效活性成分和202个预测作用靶点,对应的主要化学成分为槲皮素、山柰酚和?-谷甾醇,与骨质疏松有关的疾病靶点共计4 603个,与杜仲有共计144个共同作用靶点,在这144个关键靶点的PPI网络中筛选后得到14个关键靶点。关键靶点的基因富集结果显示,PTGS2、HSP90AA1、PPARG、ESR1和JUN等核心靶点主要通过...
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关 键 词: | 骨质疏松 杜仲 网络药理学 信号通路 分子对接 |
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