奶牛乳房炎相关IRF5基因CDS区克隆及表达分析 |
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引用本文: | 闫涛涛,姚婷婷,王正兴,马楠,蓝贤勇,周力,王兴平,罗仍卓么.奶牛乳房炎相关IRF5基因CDS区克隆及表达分析[J].西南农业学报,2023(5):1097-1104. |
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作者姓名: | 闫涛涛 姚婷婷 王正兴 马楠 蓝贤勇 周力 王兴平 罗仍卓么 |
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作者单位: | 1. 宁夏大学农学院;2. 宁夏回族自治区反刍动物分子细胞育种重点实验室;3. 西北农林科技大学动物科技学院 |
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基金项目: | 宁夏自然科学基金项目(2022AAC03056);;宁夏高等学校科学研究项目(NGY2020007); |
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摘 要: | 【目的】研究奶牛干扰素调节因子5(Interferon regulatory factor 5,IRF5)基因在奶牛乳腺组织及乳腺上皮细胞炎症中的表达模式。【方法】利用RT-PCR和测序技术克隆得到IRF5基因的编码区(Coding sequence, CDS)序列,并采用生物信息学方法分析IRF5基因及其特性;利用qPCR技术检测IRF5基因及相关干扰素调节因子3(Interferon regulatory factor 3,IRF3)和MyD88基因的表达量。【结果】IRF5基因的CDS长度为1500 bp,编码499个氨基酸,存在47个潜在磷酸化位点,氨基酸组成中脯氨酸(Pro)和亮氨酸(Leu)所占比例较高。IRF5蛋白分子式为C2524H3901N671O728S20,主要存在于细胞核和线粒体,理论等电点为5.38,是碱性亲水且不稳定的非分泌蛋白。蛋白互作分析结果显示,IRF5蛋白可能与骨髓分化初级反应蛋白(MyD88)、白细胞介素-1受体相关激酶1(IRAK1)、C...
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关 键 词: | 奶牛 乳房炎 IRF5基因 生物信息学分析 基因表达 乳腺上皮细胞 |
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