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辣椒推定WRKY基因cDNA的生物信息学分析
引用本文:王育娜,贺 俐,曹 蕾,赖 燕,牟少亮,何水林.辣椒推定WRKY基因cDNA的生物信息学分析[J].中国农学通报,2008,24(11):93-96.
作者姓名:王育娜  贺 俐  曹 蕾  赖 燕  牟少亮  何水林
作者单位:1. 福建农林大学生命科学学院,福州,350002;洛阳师范学院生命科学系,洛阳,471022
2. 井岗山大学生命科学学院,吉安,343009
3. 漳州农业学校,漳州,363000
4. 福建农林大学生命科学学院,福州,350002
摘    要:本研究在利用同源克隆法分离到一个推定的辣椒WRKY 转录因子的基础上,采用多种生物信息学方法对该序列进行特征分析和功能预测, 以获得该基因及其编码蛋白更多的功能提示。方法: 应用B1ast、ORF Finder、Wolf Psort、DNAMAN等软件或数据库, 进行序列的相似性比较, 开放读码框预测、保守域和编码蛋白质的功能等分析。结果: 我们得到的WRKY序列是该基因家族中的一个全长cDNA序列, 该基因编码的蛋白具有WRKY保守结构域和锌指结构特征, 亚细胞定位预测结果显示该蛋白定位于细胞核。结论: 辣椒WRKY新基因是一新成员, 进化上保守有保守性, 可能在在调控植物的生长发育以及干旱、高温、高盐等逆境应答过程中起重要调节作用。因此, 这一辣椒WRKY新基因有进一步研究的价值。

关 键 词:Bt棉    Bt棉    钾肥    产量    效应
收稿时间:2008-09-24
修稿时间:1/1/1900 12:00:00 AM

Bioinformation Analyze of a Pepper Putative WRKY gene
Wang Yun,He Li,Cao Lei,Lai Yan,Mou Shaoliang,He Shuilin.Bioinformation Analyze of a Pepper Putative WRKY gene[J].Chinese Agricultural Science Bulletin,2008,24(11):93-96.
Authors:Wang Yun  He Li  Cao Lei  Lai Yan  Mou Shaoliang  He Shuilin
Abstract:
Keywords:WRKY
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