低温胁迫下海滨木槿的转录组分析 |
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引用本文: | 赵文静,郑旭,葛金涛,刘兴满,缪美华,孔祥伟.低温胁迫下海滨木槿的转录组分析[J].江苏农业科学,2023(5):56-64. |
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作者姓名: | 赵文静 郑旭 葛金涛 刘兴满 缪美华 孔祥伟 |
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作者单位: | 1. 连云港市农业科学院 |
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摘 要: | 海滨木槿(Hibiscus hamabo Sieb.et Zucc.)是一种典型的耐盐植物,甚至能够在海水中生长,是沿海滩涂绿化的绝佳绿化树种,但在栽培试验中发现海滨木槿不耐寒,很难在北方地区越冬。为探究海滨木槿在低温胁迫下的分子应答机制,挖掘海滨木槿的抗寒基因,培育耐寒海滨木槿,通过转录组测序(RNA-seq)的试验方法分析海滨木槿在低温胁迫下的差异基因表达情况。试验结果表明,低温胁迫下的处理组与常温对照相比,共有23 689个差异表达基因,其中上调表达基因10 256个,下调表达基因13 433个。通过GO富集分析,发现差异基因大多富集在代谢过程、细胞过程、膜、催化活性等方面;通过KEGG的富集分析,发现这些差异基因大多富集在代谢途径、次生代谢物的生物合成、光合作用、植物昼夜节律、植物激素信号转导等方面,本研究还筛选了一些潜在的耐寒差异基因,如FKF1、GI、PYL、PP2C、CML、CPK、SNRK2、NCED和BIN2等。本试验结果可为研究海滨木槿的耐寒机制以及培育海滨木槿耐寒品种提供技术参考和基础。
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关 键 词: | 海滨木槿 低温胁迫 转录组 差异基因 耐寒 |
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