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牛冠状病毒TaqMan荧光定量检测方法的建立及国内部分地区流行病学调查
作者姓名:黄金  李思远  谢玲玲  周迪  杨蓉  王松  周华  蔡旭航  李基棕  李彬
作者单位:1. 江苏省农业科学院兽医研究所/农业农村部兽用生物制品工程技术重点实验室;2. 南京农业大学动物医学院;3. 西北农林科技大学动物医学院;4. 贵州省种畜禽种质测定中心;5. 贵州省草地技术试验推广站;7. 江苏大学生命科学学院食品与生物工程学院
基金项目:国家重点研发计划(编号:2021YFD1801101);;江苏省自然科学基金(编号:BK20221432);
摘    要:牛冠状病毒(BCoV)在全球广泛存在,在临床上能引起牛腹泻以及呼吸道感染,给养殖业带来巨大经济损失。为快速批量检测临床样品、分析国内的BCoV隐性感染及流行情况,根据BCoV的N基因序列设计了引物和探针,建立了TaqMan荧光定量RT-PCR检测方法,对其特异性、敏感性、重复性进行评估,并将其与靶向BCoV的N基因的常规RT-PCR方法进行对比。利用本方法对采集自我国西藏、江苏、河北、贵州、安徽等5个省份的22个未发病牛场的35份口腔拭子样品和244份粪便样品进行检测以了解流行情况。结果表明,质粒标准品拷贝数的对数与CT值呈现良好稳定的负线性关系,标准曲线为y=-3.441 8x+39.584 0,r2=0.999 4,E=98.2%;最低检测拷贝数为6.0×10拷贝/μL,重复性变异系数均<5%;对临床样品进行检测,检出率明显高于常规RT-PCR方法。对22个牛场的279份病料进行检测,结果显示BCoV的总体阳性率为73.12%,牛场阳性率为100.00%。本研究成功建立了靶向BCoV N基因、灵敏度高、特异性好的荧光定量RT-PCR...

关 键 词:牛冠状病毒  TaqMan荧光定量  样品检测  隐性感染  RT-PCR
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