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用焦磷酸测序技术检测凡纳滨对虾组织蛋白酶基因单核苷酸多态性
引用本文:曾地刚,陈晓汉,彭敏,李咏梅,杨春玲,马宁,蒋伟明,黎铭. 用焦磷酸测序技术检测凡纳滨对虾组织蛋白酶基因单核苷酸多态性[J]. 水产学报, 2008, 32(5): 684-689
作者姓名:曾地刚  陈晓汉  彭敏  李咏梅  杨春玲  马宁  蒋伟明  黎铭
作者单位:广西水产研究所,广西,南宁,530021;广西水产研究所,广西,南宁,530021;广西水产研究所,广西,南宁,530021;广西水产研究所,广西,南宁,530021;广西水产研究所,广西,南宁,530021;广西水产研究所,广西,南宁,530021;广西水产研究所,广西,南宁,530021;广西水产研究所,广西,南宁,530021
基金项目:国家科技支撑计划,广西新世纪十百千人才工程项目
摘    要:焦磷酸测序是一种新型的DNA测序技术,近年来开始应用于单核苷酸多态性(SNPs)检测.组织蛋白酶基因(Cathepsin-L,CTSL)在对虾的蜕皮周期中起重要的作用.本研究利用焦磷酸测序技术,对96个凡纳滨对虾的CTSL基因序列(GnBank登录号:AY366355)的C681G SNP位点进行检测分型.结果发现C/C、C/G和G/G基因型,频率分别是0.81、0.16和0.03,频率分布符合Hardy-Weinberg平衡.统计分析结果表明在该群体中C681G SNP和体重关系不显著(P>0.05).研究结果显示焦磷酸测序技术是一种高效的SNP检测技术,可以在对虾的遗传研究中发挥重要作用.

关 键 词:凡纳滨对虾  焦磷酸测序  组织蛋白酶基因  单核苷酸多态性
收稿时间:2007-08-15
修稿时间:2008-01-28

Detection of CTSL gene single nucleotide polymorphisms in Litopenaeus vannamei Shrimp by Pyrosequencing
ZENG Di-gang,CHEN Xiao-han,PENG Min,LI Yong-mei,YANG Chun-ling,MA Ning,JIANG Wei-ming,LI Ming. Detection of CTSL gene single nucleotide polymorphisms in Litopenaeus vannamei Shrimp by Pyrosequencing[J]. Journal of Fisheries of China, 2008, 32(5): 684-689
Authors:ZENG Di-gang  CHEN Xiao-han  PENG Min  LI Yong-mei  YANG Chun-ling  MA Ning  JIANG Wei-ming  LI Ming
Affiliation:Guangxi Institute of Fisheries,Guangxi Institute of Fisheries,Guangxi Institute of Fisheries,Guangxi Institute of Fisheries,Guangxi Institute of Fisheries,Guangxi Institute of Fisheries,Guangxi Institute of Fisheries and Guangxi Institute of Fisheries
Abstract:
Keywords:Pyrosequencing  Litopenaeus vannamei  cathepsin-L gene   single nucleotide polymorphisms
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