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不结球白菜BcGAPDH的生物信息学分析
引用本文:马景蕃,刘喜明,陈小红. 不结球白菜BcGAPDH的生物信息学分析[J]. 湖北农业科学, 2016, 0(11): 2917-2920. DOI: 10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2016.11.053
作者姓名:马景蕃  刘喜明  陈小红
作者单位:1. 龙岩学院生命科学学院,福建龙岩364012;福建省预防兽医学与兽医生物技术重点实验室,福建龙岩364012;2. 龙岩学院艺术与设计学院,福建龙岩,364012
基金项目:福建省科技厅重点项目(2012N0020),福建省教育厅A类项目(JA12320),国家自然科学基金培育项目(LG2014014)
摘    要:采用生物信息学方法对克隆测序的不结球白菜(Brassica campestris ssp.chinensis)Bc GAPDH(3-磷酸甘油醛脱氢酶)蛋白质的理化性质、跨膜区、亲水性、亚细胞定位、所含模体及蛋白质结构进行了预测。理化性质分析表明,该酶含有328个氨基酸,相对分子量为35 161.2,p I值为9.03。TMpred跨膜分析表明,该酶没有跨膜螺旋区,这与Prot Scale预测的该酶为亲水性蛋白质相吻合。用Target P server程序预测该酶定位于线粒体上,结构域分析表明该酶含有多种磷酸化位点,二级结构以α-螺旋和随机卷曲为主。借助SWISS-MODEL软件对该酶进行了三维同源建模。

关 键 词:不结球白菜(Brassica campestris ssp.chinensis)  BcGAPDH  生物信息学

Bioinformatic Analysis of BcGAPDH from Brassica campestris ssp.chinensis
Abstract:
Keywords:Brassica campestris ssp.chinensis  BcGAPDH  bioinformation
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