| 高通量测序技术研究棉蚜携带病毒种类 |
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| 引用本文： | 张帅,吕丽敏,王春义,雒珺瑜,李春花,崔金杰.高通量测序技术研究棉蚜携带病毒种类[J].棉花学报,2014,26(6):539-545. |
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| 作者姓名： | 张帅 吕丽敏 王春义 雒珺瑜 李春花 崔金杰 |
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| 作者单位： | 棉花生物学国家重点实验室/中国农业科学院棉花研究所,河南安阳,455000 |
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| 基金项目： | 转基因生物新品种培育重大专项 |
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| 摘 要： | 棉蚜是传播寄主植物病毒的主要昆虫媒介,但对棉蚜携带的病毒种类及病毒基因组序列信息了解较少。本文利用高通量测序技术,对棉蚜田间自然种群所携带的病毒基因序列进行发掘、鉴定和分类。通过对田间苗蚜和伏蚜转录组数据进行分析,获得18种病毒基因组序列,其中17种病毒为未报道过基因组信息的种类。在18种病毒中,有13种为正链RNA病毒。苗蚜携带病毒的种类和数量都远远高于伏蚜,苗蚜携带全部的18种病毒;伏蚜仅携带8种,而且携带病毒的FPKM(Fragments per kb per million fragments)值较低。本研究丰富了棉蚜所携带的病毒基因组信息,为棉蚜传毒机制研究打下基础。
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| 关 键 词： | 棉蚜 病毒 高通量测序 基因组 转录组 |
| 收稿时间： | 2014-03-21 |
Study on Cotton Aphid-borne Viruses via High-Throughput Sequencing |
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| Zhang Shuai,Lyu Limin,Wang Chunyi,Luo Junyu,Li Chunhua,Cui Jinjie.Study on Cotton Aphid-borne Viruses via High-Throughput Sequencing[J].Cotton Science,2014,26(6):539-545. |
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| Authors: | Zhang Shuai Lyu Limin Wang Chunyi Luo Junyu Li Chunhua Cui Jinjie |
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| Institution: | State Key Laboratory of Cotton Biology / Institute of Cotton Research, CAAS, Anyang, Henan 455000, China |
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