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小麦矮腥黑粉菌效应蛋白g10613的基因克隆与生物信息学分析
作者姓名:郭志浩  高利  刘琦
作者单位:1. 中国农业科学院植物保护研究所/植物病虫害生物学国家重点实验室;2. 新疆农业大学农学院/农林有害生物监测与安全防控重点实验室
摘    要:本研究重点分析小麦矮腥黑粉菌的g10613基因编码效应蛋白的生物学功能。根据小麦矮腥黑粉菌基因组测序结果,筛选出编码效应蛋白基因g10613作为主要研究对象。将效应蛋白基因g10613成功克隆,并运用多种生物信息学数据库,解析了该蛋白的理化性质、保守结构域、跨膜区、亲疏水性以及信号肽。结果表明:g10613基因全长330 bp,共编码109个氨基酸;它所编码的效应蛋白质没有明显的家族结构特征;该蛋白质中亲水的氨基酸数量更多,是偏亲水蛋白质;在跨膜区分析中,它存在一个跨膜区,处于0~23氨基酸的位置。

关 键 词:小麦矮腥黑粉菌  g10613  基因克隆  生物信息学分析
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