| 草鱼MKLN1基因可变剪接和微卫星序列的多态性 |
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| 引用本文： | 徐冰,徐义平,鲍宝龙. 草鱼MKLN1基因可变剪接和微卫星序列的多态性[J]. 上海水产大学学报, 2011, 0(5) |
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| 作者姓名： | 徐冰 徐义平 鲍宝龙 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学省部共建水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室;浙江省乐清市海洋与渔业局; |
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| 基金项目： | 上海市教育委员会重点学科建设项目(S30701和J50701) |
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| 摘 要： | MKLN1基因编码的muskelin蛋白主要通过其羧基端的kelch重复结构域与其它蛋白形成复合物行使功能。通过分析草鱼鳃组织的基因转录谱,发现其中的MKLN1基因存在(CT)15的微卫星序列,通过检测3个不同的草鱼种群,又发现(CT)9、(CT)10、(CT)11和(CT)13 4种多态性序列。通过克隆该段MKLN1基因组序列并与斑马鱼和红鳍东方鲀的MKLN1基因组序列比较,发现克隆得到的草鱼基因序列是由一个内含子和两个外显子组成,共编码144个氨基酸。通过进一步调查不同组织该基因的转录本,发现存在内含子剪接和内含子未被剪接的两个转录本。由于内含子序列未被剪接的转录本在内含子中存在TGA终止密码子,导致MKLN1基因翻译提前终止,翻译产物为失去部分kelch结构域的muskelin蛋白。相对于内含子正常剪接的转录本,没有被剪接内含子的转录本在各种组织中的表达量要明显低得多。简而言之,本研究发现了草鱼MKLN1转录本中的微卫星序列是来自未被剪切的内含子,而未被剪切的内含子导致该转录本编码部分kelch结构域缺失的muskelin蛋白。研究亮点:目前对于可直接锚定功能基因的I型微卫星标记研究很少。本文首次发现M...
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| 关 键 词： | 草鱼 MKLN1 微卫星多态性 可变剪接 |
Polymorphic microsatellite in the alternative splicing transcription of MKLN1 in Ctenopharyngodon idellus |
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| XU Bing,XU Yi-ping,BAO Bao-long. Polymorphic microsatellite in the alternative splicing transcription of MKLN1 in Ctenopharyngodon idellus[J]. Journal of Shanghai Fisheries University, 2011, 0(5) |
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| Authors: | XU Bing XU Yi-ping BAO Bao-long |
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| Affiliation: | XU Bing1,XU Yi-ping2,BAO Bao-long1 (1.Key Laboratory of Exploration and Utilization of Aquatic Genetic Resources,Shanghai Ocean University,Ministry of Education,Shanghai 201306,China,2.Bureau of Marine and Fisheries,Yueqing 325600,Zhejiang,China) |
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| Abstract: | Muskelin coded by MKLN1 gene participates in signal transduction,cell-matrix adhesion and cellular component movement as an intracellular protein.In previous study,MKLN1 containing 15 repeats of dinucleotide(CT) was identified from a cDNA library of grass carp,Ctenopharyngodon idellus.To further investigate the polymorphism of the dinucleotide,we examined ten individuals from three different grass carp population in this research and identified other different repeats of dinucleotide as(CT)9,(CT)10,(CT)11 a... |
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