牦牛TBC1D7基因克隆、生物信息学及表达分析 |
| |
作者姓名: | 张娟香 欧杰次仁 喇永富 马晓明 吴晓云 郭宪 褚敏 阎萍 梁春年 |
| |
作者单位: | 1. 中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育重点实验室,农业农村部青藏高原畜禽遗传育种重点实验室;2. 甘肃农业大学动物科学技术学院;3. 西藏娘亚牦牛养殖产业发展有限责任公司 |
| |
基金项目: | 国家重点研发计划项目(2022YFD1302101);;现代肉牛牦牛产业技术体系项目(CARS-37); |
| |
摘 要: | 为探究西藏牦牛Tre2-Bub2-CDC16结构域家族成员7(TBC1D7)基因的特征及结构,利用RT-PCR克隆了TBC1D7基因的CDS区序列,并对其进行了生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR(qPCR)检测了TBC1D7基因在牦牛心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、肌肉及脂肪组织的表达水平。结果表明,牦牛TBC1D7基因的CDS区全长为882 bp,共编码293个氨基酸;系统进化树分析结果表明,西藏牦牛与野牦牛的亲缘关系最近,与兔的最远;生物信息学分析结果表明,牦牛TBC1D7蛋白不存在信号肽和跨膜结构,属于亲水性蛋白,主要存在细胞核中,且该蛋白具有24个潜在的磷酸化位点,蛋白的高级结构由α-螺旋(65.53%)、延伸连(3.75%)、β-转角(3.75%)和无规则卷曲(29.96%)构成。qPCR检测结果显示,TBC1D7基因在西藏牦牛脾脏组织中的表达最高,极显著高于其他组织(P <0.01)。
|
关 键 词: | 西藏牦牛 TBC1D7基因 克隆 生物学分析 组织表达 |
|
|