蒺藜苜蓿GPAT基因家族的全基因组鉴定、序列变异和表达分析 |
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引用本文: | 杨成兰,段瑞君,武雄雄,祁存英,马银花,熊辉岩.蒺藜苜蓿GPAT基因家族的全基因组鉴定、序列变异和表达分析[J].草业科学,2021,38(10). |
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作者姓名: | 杨成兰 段瑞君 武雄雄 祁存英 马银花 熊辉岩 |
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作者单位: | 青海大学生态环境工程学院,青海 西宁 810016;青海大学农牧学院,青海 西宁 810016 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;青海省科技厅应用基础研究项目 |
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摘 要: | 甘油-3-磷酸酰基转移酶(glycerol-3-phosphate acyltransferase, GPAT)是三酰甘油(triacylglycerol, TAG)生物合成的限速酶,催化TAG生物合成的起始步骤,为多种脂质合成提供了底物,会直接参与到植物的生长发育和抗逆过程。蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)作为豆科模式植物具有基因组小、生长周期短、遗传转化效率高等特点。为了解GPAT基因在苜蓿抗逆尤其是在耐盐中的作用,本研究选择蒺藜苜蓿基因组为研究对象,采用Blastp和Hmm结构域搜索方法,共鉴定出24个mtGPAT基因。根据系统进化、基因结构和结构域差异将其分成3个亚家族。同时染色体定位分析发现,24个mtGPAT基因不均匀分布在7条苜蓿染色体上,每条染色体上分布有2~5个基因。基因表达谱分析表明:蒺藜苜蓿GPAT基因具有器官特异性,并且会参与盐胁迫反应。这些结果可为进一步深入研究蒺藜苜蓿GPAT家族基因的功能提供理论基础。
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关 键 词: | 蒺藜苜蓿 基因家族 甘油-3-磷酸酰基转移酶 系统进化分析 基因表达模式分析 染色体定位 盐胁迫 |
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