| 鸡(土从)菌基因组测序和比较基因组分析 |
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| 引用本文： | 黎勇,孙明伟,杜婉婷,邓佳,陈慧,史典义.鸡(土从)菌基因组测序和比较基因组分析[J].食用菌学报,2022(6):1-13. |
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| 作者姓名： | 黎勇 孙明伟 杜婉婷 邓佳 陈慧 史典义 |
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| 作者单位： | 1. 内江师范学院生命科学学院;2. 沱江流域特色农业资源四川省科技资源共享服务平台 |
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| 摘 要： | 对采集自四川省内江市东兴区高桥村灌木林的鸡(土从)菌(Termitomyces albuminosus)进行基因组测序、组装、基因功能注释、碳水化合物酶(carbohydrate-active enzyme,CAZy)预测、进化树构建、同源序列比对及简单重复序列(simple sequence repeat,SSR)分子标记开发和PCR扩增验证的研究工作。结果表明：鸡(土从)菌全基因组共存在1.71×103个蛋白质编码基因，平均长度为1.65×103 bp;CAZy功能注释聚类分析表明，黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、内华达古白蚁(Zootermopsis nevadensis)、面包酵母(Saccharomyces cerevisiae)和裂体吸虫(Schistosomamansoni)聚类到同一大组，鸡(土从)菌与其他物种聚类到另一大组，且与刺芹侧耳(Pleurotus eryngii)和糙皮侧耳(P. ostreatus)聚类到更小分组；进化树分析表明，蚁巢伞属真菌与常见的栽培食用菌之间存在一定的进化距离，与...
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| 关 键 词： | 鸡(土从)菌 白蚁 基因组组装 比较基因组 简单重复序列 |
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