| 基于RNA_Seq技术分析对乙酰氨基酚对斑马鱼转录组的影响 |
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| 引用本文： | 康桂英,董武,杨景峰,杨晓野. 基于RNA_Seq技术分析对乙酰氨基酚对斑马鱼转录组的影响[J]. 中国兽医学报, 2019, 0(10): 2033-2039 |
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| 作者姓名： | 康桂英 董武 杨景峰 杨晓野 |
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| 作者单位： | 1.内蒙古农业大学兽医学院;2.内蒙古民族大学动物科学技术学院/内蒙古自治区毒物监控及毒理学重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金资助项目(21267015,81360508,21567019);内蒙古自然科学基金资助项目(2015MS0804);内蒙古科技创新引导资助项目(KJCX15003);草原英才工程资助项目(2017-2020);内蒙古民族大学特色交叉学科群建设资助项目(MDXK008);内蒙古毒物监控及毒理学重点实验室开放课题资助项目(MDK2017012) |
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| 摘 要： | 为了研究对乙酰氨基酚对斑马鱼发育影响,采用高通量转录组测序RNA-seq技术对对乙酰氨基酚处理组(CAPAP组)与对照组(CO组)斑马鱼进行检测,以斑马鱼基因(danio rerio assembly version GRCz10)作为参考基因组,对检测结果进行拼接与质量评估,筛选出差异表达基因,并进行GO和Pathway功能分析。荧光定量PCR对部分与肝脏有关的差异表达基因进行验证。结果表明,CO与CAPAP组的差异表达基因数量为72个,其中上调差异表达基因40个,下调差异表达基因32个。对CO与CAPAP组差异表达基因进行GO富集分析,上调基因主要富集于47个条目中,下调基因主要富集于16个条目中,这些基因涉及生物进程和分子功能等多种生物活性方面,说明对乙酰氨基酚对斑马鱼的发育有一定的影响。
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| 关 键 词： | 对乙酰氨基酚 斑马鱼 荧光定量PCR 转录组 |
Analyzing effect of acetaminophen on zebrafish transcriptome through RNA_Seq technique |
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| KANG Gui-ying,DONG Wu,YANG Jing-feng,YANG Xiao-Ye. Analyzing effect of acetaminophen on zebrafish transcriptome through RNA_Seq technique[J]. Chinese Journal of Veterinary Science, 2019, 0(10): 2033-2039 |
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| Authors: | KANG Gui-ying DONG Wu YANG Jing-feng YANG Xiao-Ye |
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| Affiliation: | (College of Veterinary Medicine , Inner Mongolia Agricultural University ,Hohhot 010018 ,China;Inner Mongolia Key Laboratary of Toxicant Monitoring and Toxicology ,School of Animal Science and Technology Inner Mongolia University for the Nationalities,Tongliao,Inner Mongolia 028000,China) |
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| Abstract: | KANG Gui-ying;DONG Wu;YANG Jing-feng;YANG Xiao-Ye(College of Veterinary Medicine , Inner Mongolia Agricultural University ,Hohhot 010018 ,China;Inner Mongolia Key Laboratary of Toxicant Monitoring and Toxicology ,School of Animal Science and Technology Inner Mongolia University for the Nationalities,Tongliao,Inner Mongolia 028000,China) |
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