| 草地早熟禾胚胎发生标记基因BBM的鉴定及系统进化分析 |
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| 引用本文： | 余江弟,苗佳敏,李玉珠,马晖玲.草地早熟禾胚胎发生标记基因BBM的鉴定及系统进化分析[J].草原与草坪,2024(2):38-48. |
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| 作者姓名： | 余江弟 苗佳敏 李玉珠 马晖玲 |
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| 作者单位： | 甘肃农业大学草业学院，草业生态系统教育部重点实验室，甘肃省草业工程实验室，中‐美草地畜牧业可持续发展研究中心，甘肃 兰州 730070 |
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| 基金项目： | 甘肃省高等学校创新基金项目（2021B-127）；甘肃农业大学科技创新基金（青年导师扶持基金）（GAU-QDFC-2021-02） |
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| 摘 要： | 【目的】利用生物信息学方法，鉴定草地早熟禾（Poa pratensis）胚胎发生标记基因PpBBM，并通过保守基序比对和进化树分析，推测可能具有孤雌生殖功能的PpBBM基因。【方法】基于草地早熟禾转录组数据库信息，检索PpBBM基因。通过生物信息学软件分析PpBBMs蛋白理化特性，比较不同PpBBMs蛋白的系统进化关系和保守基序差异。【结果】共获得3个具有完整开放阅读框的PpBBMs基因，其编码的蛋白均含有2个AP2结构域，其中，PpBBM1和PpBBM2具有相同的motif类型和数量。3个PpBBMs蛋白都是酸性蛋白，定位于细胞核，不存在跨膜结构和信号肽。系统进化分析表明，30个物种的BBM/BBML蛋白成员共聚为5类。其中，PpBBM1、PpBBM2聚在第2分支，分别与BdBBM和SbBBML亲缘关系最近；PpBBML位于第5分支，与ZmBBML亲缘关系最近。PpBBM1、PpBBM2和PpBBML均具有BBM基因所特有的bbm-1基序以及AP2亚家族特定的euANT2-4基序，但PpBBML蛋白的所有基序均有个别氨基酸残基存在变异。【结论】与PpBBML基因相比，PpBBM1和P...
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| 关 键 词： | 草地早熟禾 BBM基因 系统进化分析 保守基序 |
| 收稿时间： | 2023/3/7 0:00:00 |
| 修稿时间： | 2023/7/15 0:00:00 |
Identification and phylogenetic analysis of the embryogenic marker gene BBM in kentucky bluegrass (Poa pratensis) |
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| YU Jiang-di,MIAO Jia-min,LI Yu-zhu,MA Hui-ling.Identification and phylogenetic analysis of the embryogenic marker gene BBM in kentucky bluegrass (Poa pratensis)[J].Grassland and Turf,2024(2):38-48. |
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| Authors: | YU Jiang-di MIAO Jia-min LI Yu-zhu MA Hui-ling |
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| Institution: | College of Grassland Science,Gansu Agricultural University,Key Laboratory for Grassland Ecosystem,Ministryof Education,Grassland Engineering Laboratory of Gansu Province,Sino-U.S.Centers for Grazing Land Ecosys?tem Sustainability,Lanzhou 730070 ,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | |
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