杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因(XET)的生物信息学分析 |
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作者姓名: | 赵慧 王遂 刘笑平 林永红 王松波 宋双林 李开隆 |
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作者单位: | 1. 东北林业大学林木遗传育种国家重点实验室,黑龙江哈尔滨,150040 2. 吉林省临江林业局,吉林临江,134600 |
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基金项目: | "863"项目 |
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摘 要: | [目的]通过生物信息学方法对杂种杨树木葡聚糖内糖基转移酶基因的DNA序列、蛋白质序列进行分析预测,为进一步研究奠定基础.[方法]以XET基因及其氨基酸序列为研究对象,利用多种网络数据库及生物信息学软件对其进行分析预测.[结果]该基因编码290个氨基酸残基,相对分子质量33 672.0 D,理论等电点(pI)7.04;该酶可能存在3个卷曲结构部位、1个信号肽剪切位点和1个跨膜区,是典型的分泌蛋白;三级结构同源建模预测结果较好,二级结构预测中的螺旋、卷曲和折叠均可见.相似性比对和进化分析显示其与葡萄等的序列相似度较高;而蛋白质三级结构的预测则发现,该酶与几种杆菌的蛋白较接近.[结论]XET基因可能在很多生物中具有较高的保守性.
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关 键 词: | 杨树 木葡聚糖内糖基转移酶 生物信息学 |
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