| 牦牛 Agouti 基因的克隆及编码区多态性研究 |
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| 引用本文： | 张建一,梁春年,吴晓云,张良斌,郭宪,裴杰,阎萍. 牦牛 Agouti 基因的克隆及编码区多态性研究[J]. 华北农学报, 2014, 0(5) |
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| 作者姓名： | 张建一 梁春年 吴晓云 张良斌 郭宪 裴杰 阎萍 |
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| 作者单位： | 1. 甘肃农业大学 动物科学技术学院,甘肃 兰州 730070; 中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育重点实验室,甘肃 兰州 730050
2. 中国农业科学院 兰州畜牧与兽药研究所,甘肃省牦牛繁育重点实验室,甘肃 兰州 730050 |
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| 基金项目： | 国家科技支撑计划项目(2012BAD13B05);国家公益性行业科研项目 |
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| 摘 要： | 以Agouti基因作为牦牛毛色调控的候选基因,探索Agouti基因编码区序列多态性,以期为阐明Agouti与毛色形成的相关性及毛色形成机理奠定基础。根据GenBank已发表序列（ NM_206843）设计1对引物,以天祝白牦牛和黑色被毛甘南牦牛皮肤总RNA为模板,采用RT-PCR技术扩增,成功获得了牦牛Agouti基因编码区序列。采用生物信息学方法预测分析Agouti基因及其编码蛋白的基本理化性质、信号肽、疏水性、二级结构等;采用DNA混合池测序法和直接测序法,检测牦牛Agouti基因编码区的序列变异。结果表明,扩增得到的Agouti基因的编码区是一条长为593 bp的DNA序列。黑色甘南牦牛和天祝白牦牛皮肤的Agouti基因序列相同,并与黄牛基本一致。将牦牛的Agouti基因序列命名为YAK ASIP,并且在NCBI数据库中注册该基因的登录号为KJ630463。该基因含有一个长度为402 bp的开放性阅读框,编码133个氨基酸。 Agouti基因编码蛋白属于亲水性蛋白,有一个明显的信号肽,含有多个磷酸化位点。其二级结构主要以α螺旋和无规则卷曲为主。 Agouti基因编码产物氨基酸邻接系统树表明,牦牛Agouti与黄牛、绵羊等物种的Agouti氨基酸具有高度相似性,并且牦牛Agouti基因编码区中无多态性位点。
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| 关 键 词： | 牦牛 Agouti基因 克隆 生物信息学分析 多态性 |
Cloning of Agouti Gene in Yak and Polymorphisms Detection |
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| ZHANG Jian-yi,LIANG Chun-nian,WU Xiao-yun,ZHANG Liang-bin,GUO Xian,PEI Jie,YAN Ping. Cloning of Agouti Gene in Yak and Polymorphisms Detection[J]. Acta Agriculturae Boreali-Sinica, 2014, 0(5) |
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| Authors: | ZHANG Jian-yi LIANG Chun-nian WU Xiao-yun ZHANG Liang-bin GUO Xian PEI Jie YAN Ping |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Yak Agouti gene Cloning Bioinformatic analysis Polymorphisms |
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