| 马蔺DFR基因的克隆及生物信息学特征分析 |
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| 引用本文： | 虎娟,安韶雅,林哲,张虹,包晗,陈任.马蔺DFR基因的克隆及生物信息学特征分析[J].北方园艺,2017(24):109-115. |
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| 作者姓名： | 虎娟 安韶雅 林哲 张虹 包晗 陈任 |
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| 作者单位： | 宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点试验室,宁夏银川750021;宁夏大学生命科学学院,宁夏银川750021;宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点试验室,宁夏银川750021;宁夏大学生命科学学院,宁夏银川750021;宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点试验室,宁夏银川750021;宁夏大学生命科学学院,宁夏银川750021;宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点试验室,宁夏银川750021;宁夏大学生命科学学院,宁夏银川750021;宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点试验室,宁夏银川750021;宁夏大学生命科学学院,宁夏银川750021;宁夏大学西部特色生物资源保护与利用教育部重点试验室,宁夏银川750021;宁夏大学生命科学学院,宁夏银川750021 |
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| 基金项目： | 2013年度宁夏回族自治区科技支撑计划资助项目 |
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| 摘 要： | 以马蔺花瓣为试材,通过转录组测序,应用PCR技术克隆马蔺花青素生物合成关键酶二羟黄酮醇-4-还原酶(dihydvroflavonol-4-reductase,DFR)基因并获得其生物信息学特征。结果表明:马蔺DFR基因全长1 427bp,共编码357个氨基酸(该基因命名为IlDFR,GenBank登录号为KY907171)。该基因在氨基酸水平上与多种植物的DFR具有较高的同源性,在系统进化上与同属的荷兰鸢尾(Iris hollandica)的DFR亲缘关系较近;预测其蛋白质相对分子质量为39.99kDa,等电点为5.89,主要由α-螺旋和β-折叠构成,定位于细胞质,属于酸性亲水不含信号肽的不稳定类蛋白质。马蔺IlDFR有一段氨基酸序列‘VTGASGYVGSWLVMKLLRDGY’与大部分物种的DFR特有相对保守的NADPH结合域非常相似,只有4个氨基酸残基有所差异。
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| 关 键 词： | 马蔺 转录组测序 花青素 二羟黄酮醇-4-还原酶 生物信息学分析 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of DFR Gene From Iris lactea Pail.var.chinensis (Fisch.) Koidz |
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