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基因Ⅰ型草鱼呼肠孤病毒TaqMan Real-Time PCR检测方法的建立及应用
引用本文:殷亮,王庆,曾伟伟,李永刚,王英英,刘春,梁红茹,石存斌,吴淑勤. 基因Ⅰ型草鱼呼肠孤病毒TaqMan Real-Time PCR检测方法的建立及应用[J]. 水产学报, 2014, 38(4): 570-576
作者姓名:殷亮  王庆  曾伟伟  李永刚  王英英  刘春  梁红茹  石存斌  吴淑勤
作者单位:珠江水产研究所,上海海洋大学水产与生命学院,珠江水产研究所
基金项目:国家科技支撑计划(2012BAD25B02),国家自然科学基金(31202026)
摘    要:为了建立和应用可检测基因Ⅰ型草鱼呼肠孤病毒(GCRV)的荧光定量检测方法,实验根据基因Ⅰ型GCRV的S6保守序列,分别设计扩增目的条带661 bp普通引物(P1、P2)、扩增目的条带159 bp荧光定量引物(F1、F2)和一条探针;同时构建含有目的片段的PVAX1-S6作为标准质粒,10倍梯度稀释构建质粒拷贝数与Ct值的标准曲线(Y=-3.389X+38.076)。结果表明,此方法在3.9×107~3.9×101拷贝/μL之间相关性较好,R2为0.992,最小检测量为4拷贝/μL;且与基因Ⅱ型、Ⅲ型GCRV以及其他病原核酸无交叉反应。运用该方法检测16份草鱼出血病疑似样品,阳性结果为4份;而普通PCR检测仅2份显示阳性。本研究建立了针对基因Ⅰ型GCRV的荧光定量检测方法,具有高效、特异、灵敏、可重复性强的优点,适合于目前基因Ⅰ型GCRV的临床快速检测和病毒定量分析。

关 键 词:草鱼呼肠孤病毒  基因I型  Real-Time PCR  定量分析
收稿时间:2013-10-26
修稿时间:2014-03-03

Establishment and application of a TaqMan real-time PCR assay for detection of grass carp reovirus genotype I
YIN Liang,WANG Qing,ZENG Weiwei,LI Yonggang,WANG Yingying,LIU Chun,LIANG Hongru,SHI Cunbin and WU Shuqin. Establishment and application of a TaqMan real-time PCR assay for detection of grass carp reovirus genotype I[J]. Journal of Fisheries of China, 2014, 38(4): 570-576
Authors:YIN Liang  WANG Qing  ZENG Weiwei  LI Yonggang  WANG Yingying  LIU Chun  LIANG Hongru  SHI Cunbin  WU Shuqin
Affiliation:Pearl River Fisheries Research Institute,College of Fisheries and Life Science, Shanghai Ocean University,Pearl River Fisheries Research Institute
Abstract:
Keywords:grass carp reovirus (GCRV)   genotype I   TaqMan real-time PCR   quantitative analysis
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